Quantify. P放置 I通过自上而下的质谱法(QPI)

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    生物分子质谱和彩易福彩组学,Bijvoet生物分子研究中心和乌得勒支研究所,Padualaan 8,3584 Ch Utrecht,Utrecht University,荷兰

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    生物分子质谱和彩易福彩组学,Bijvoet生物分子研究中心和乌得勒支研究所,Padualaan 8,3584 Ch Utrecht,Utrecht University,荷兰

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    细胞和化学生物学系,奈登大学医学中心,莱顿,荷兰莱顿
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  • 作者脚注
    $已故5月19日,2020年5月19日
    Huib Ovaa.
    脚注
    $已故5月19日,2020年5月19日
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    细胞和化学生物学系,奈登大学医学中心,莱顿,荷兰莱顿
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    生物分子质谱和彩易福彩组学,Bijvoet生物分子研究中心和乌得勒支研究所,Padualaan 8,3584 Ch Utrecht,Utrecht University,荷兰

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  • A.F. Maarten Altelaar.
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    生物分子质谱和彩易福彩组学,Bijvoet生物分子研究中心和乌得勒支研究所,Padualaan 8,3584 Ch Utrecht,Utrecht University,荷兰

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  • Richard A. Scheltema
    一致
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    生物分子质谱和彩易福彩组学,Bijvoet生物分子研究中心和乌得勒支研究所,Padualaan 8,3584 Ch Utrecht,Utrecht University,荷兰

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  • 作者脚注
    $已故5月19日,2020年5月19日
开放访问发布:3月9日,2021年DOI://doi.org/10.1016/j.mcpro.2021.100070

      强调

      • 完整彩易福彩的ETD碎片显示出存在的存在性异构体 以前展示了肽;
      • 从彩易福彩的碎片光谱到40kDa这些位置异构体可以 准确量化;
      • 应用于 体外 磷酸化的蛀虫揭示了各种位置异构体;
      • 片段离子FDR水平的定义有助于提高提取的质量 stoichiometries.

      抽象的

      彩易福彩组学暴露过血清翻译后修饰,但展示 功能相关性需要新方法。完整彩易福彩的顶部下降彩易福彩组学 有可能在数量方面充分表征彩易福彩修改, 网站和它们沉积在彩易福彩上的顺序;信息 到目前为止一直难以通过霰弹枪彩易福彩组学提取。数据采集​​与分析 完整的多种改性彩易福彩,但特别是一项主要挑战 对于在不同部位进行相同数量的修饰的位置异构体。 先前提出了解决方案以从碎片中提取这些信息 光谱,但到目前为止这些主要受到肽,并留下了一个 大程度的手工解释。在这里,我们应用高分辨率orbitrap融合 自上而下的分析与生物信息学的结合分析,以尝试表征 乘法改性彩易福彩和量化定位异构体。自动共价片段 离子类型定义,检测质量精度和精度,大量使用 复制光谱会增加序列覆盖并驱动虚假片段分配 从10%到1.5%。片段分配的这种改进性能是本地化的关键 并量化片段光谱的修改。该方法通过调查来测试 泛素的位置异构体以已知的浓度混合,这导致定量 高比率在非常低的平均值(<5%),以及合成 磷酸化肽。应用于多磷酸化的Bora提供了估计 已知的已知磷酸盐位点和尚未翻新的到目前为然未知的化学计量 来自超磷酸化Bora的新网站。

      图形概要

      缩写:

      ETD. (电子转移解离), FDR. (假发现率), SEM. (标准错误的平均值)

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