Zika.和登革热感染的新蛋白质组学特征

开放访问发布:2月11日2021年DOI://doi.org/10.1016/j.mcpro.2021.100052

      强调

      • 具有极端蛋白质丰度范围的人血清样品分析
      • Zika.和登革热病毒感染的独特蛋白质签名
      • 蛋白质签名的时间变化作为过去感染的指标
      • 机器学习考虑混淆因素

      抽象的

      区分Zika和登革热病毒感染对于准确的治疗至关重要, 但我们仍然缺乏对他们对主人的影响的详细了解。识别 我们使用下一代蛋白质组学的两种感染的新蛋白质签名 轮廓122血清样品来自62个Zika和登革热患者。我们量化了>500 proteins 并确定了13种蛋白质显着表达(调整 p-价值<0.05)。这些蛋白质通常在感染和伤口愈合中起作用, 有几个也与妊娠和大脑功能相关联。我们成功验证了 在原始和独立的表达与碳酸酐酶2的表达差异 样本集。三种差异表达的蛋白质, IE。预测纤维蛋白原α,血小板因子4变体1和血小板碱性蛋白质 Zika病毒感染~70%,真阳性和6%的假阳性率。更多, 我们表明,蛋白质签名的内在时间变化可以消除歧义 诊断并用作过去感染的指标。我们一起展示了 该血清蛋白质组学可以提供用于区分的新资源 不同的病毒感染。

      图形概要

      关键词

      缩写:

      CDC (疾病控制中心), 达达 (数据依赖性收购), 丹佛 (登革热病毒), DIA (独立数据的收购), 埃莉莎 (酶联免疫吸附测定), FGA. (纤维蛋白原α.), 娜娜 (核酸扩增试验), PF4V1 (血小板因子4变体1), PPBP. (促血小板碱性蛋白质), PRNT. (斑块或聚焦减少中和测试), QC. (质量控制), RT. (保留时间), ZIKV. (Zika.病毒)

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