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碰撞横截面辅助前体选择(CAPS-PASEF)的优势用于交联质谱

  • 芭芭拉Steigenberger.
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    生物分子质谱和彩易福彩组学,Bijvoet生物分子研究中心和乌得勒支大学制药科学研究所,Utrecht,荷兰

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    化学生物学系&乌得勒德大学制药科学研究所的药物发现,荷兰乌得勒支
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  • Henk W.P. van denorn.
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  • emiel bijl.
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  • Jean-FrançoisGreisch
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  • Albert J.r. Heck.
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  • Richard A. Scheltema
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      离子迁移率基于它们的物理化学物质分离气相中的分子 属性,提供有关其大小作为碰撞横截面的信息。 TIMSTOF PRO将被困的离子移动性与四极,碰撞单元和 TOF质量分析仪,以高速探测离子,随着持续的碎片。这里, 我们表明,在该平台上,离子移动性对于交联MS(XL-MS)是有益的。 交联试剂在近距离共价链接氨基酸,导致肽 蛋白水解消化后的对。这些交联肽通常存在 在正常肽背景下的低丰度,可以部分地解决 通过使用可富集的交联试剂。即使有一个非常有效的富集 交联试剂,如Phox,交联肽的分析仍然受到阻碍 通过共同富集与部分水解的试剂相连的肽 单键肽。用于旨在揭示彩易福彩 - 彩易福彩相互作用的实验 这些是不需要的副产品。在这里,我们证明了通过离子的气相分离 迁移率能够将单键肽与交联肽分离 对。在500Å的CCS中观察到这两个类之间的清晰分区2 和2kDa的单同话题质量,可用于靶向前体选择。 总共50-70%的单键肽进行测序,允许 专注于测序相关交联肽对的分析。在应用中 简单的彩易福彩和彩易福彩混合物和完全高度复合的裂解物 该方法提供了检测到的交联肽的大幅增加。

      图形概要

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