SARS-COV-2研究和测试的数据,试剂,测定和蛋白质组学的优点

      随着Covid-19大流行继续传播,全球数千家科学家 改变了研究方向,了解病毒如何工作和寻找如何 如何解决它。预印件服务器上的稿件数量飙升 使用基于MS的蛋白质组学的同伴审查的出版物开始出现。 为了促进对SARS-COV-2的蛋白质组学研究,导致Covid-19的病毒,这 报告显示深度蛋白质蛋白质(10,000个蛋白质;>130,000个肽)共同 细胞系模型,特别是Vero E6,Calu-3,Caco-2和Ace2-A549所表征的 它们的蛋白质表达谱,包括病毒进入因子,如ACE2或TMPRSS2。 使用9kDa蛋白SRP9和乳腺癌癌症BRCA1作为示例,我们 展示蛋白质组表达数据如何用于优化蛋白质编码的注释 非洲绿色猴子和vero细胞系基因组的地区。监测变更 蛋白质组对病毒感染揭示了广泛的表达变化,包括 转录调节剂,蛋白酶抑制剂和参与先天免疫的蛋白质。 基于稳定同位素的图书馆标记为合成肽,代表11 SARS-COV-2蛋白,我们开发了纳米流量的PRM(并联反应监测)测定 和微流量LC-MS / MS。我们评估了使用上清液的这些PRM测定的优点 病毒感染的Vero E6细胞并通过分析两个诊断来挑战测定 24(+30)SARS-COV-2阳性和28(+ 9)负病例的群组。鉴于 获得的结果并在预印度服务器上包括最近的出版物或稿件, 我们批判性地讨论了SARS-COV-2研究的基于MS的蛋白质组学的优点 testing.

      图形概要

      参考

        • Greco T.M.
        • 克里斯特芹。
        蛋白质组学描绘传染病的脚步。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2017; 16: S5-S14
        • 戈登D.E.
        • jang g.m.
        • Bouhaddou M.
        • 徐J.
        • 麻醉师K.
        • 白3.
        • O'Meara M.J.
        • Rezelj V.v.
        • Guo J.Z.
        • Swaney D.L.
        • tmmino t.a.
        • Huettenhain R.
        • 卡克·丽鱼
        • Richards A.L.
        • Tutuncuoglu B.
        • Foussard H.
        • Batra J.
        • Haas K.
        • Modak M.
        • kim m.
        • 哈斯P.
        • 波拉科克B.J.
        • Braberg H.
        • 薄果准噶姆。
        • ECKHARDT M.
        • Soucheray M.
        • Bennett M.J.
        • Cakir M.
        • McGregor M.J.
        • 李问:
        • 迈尔B.
        • roesch f.
        • vallet t.
        • Mac Kain A.
        • Miorin L.
        • 莫雷诺E.
        • 天真Z.Z.C.
        • 周Y.
        • 彭S.
        • 施y.
        • 张Z.
        • 沉W.
        • 柯比I.T.
        • Melnyk J.E.
        • Chorba J.S.
        • 娄K.
        • 戴S.A.
        • Barrio-Hernandez I.
        • MEMON D.
        • Hernandez-Armenta C.
        • Lyu J.
        • mathy c.j.p.
        • 佩里卡T.
        • Pilla K.B.
        • Ganesan S.J.
        • Saltzberg D.J.
        • rakesh r.
        • 刘X.
        • 罗森希尔S.B.
        • Calviello L.
        • Venkataramanan S.
        • liboy-lugo J.
        • 林Y.
        • 黄X.-P.
        • 刘Y.
        • wankowicz s.a.
        • Bohn M.
        • Safari M.
        • Ugur F.S.
        • KOH C.
        • 萨马尔
        • Tran Q.D.
        • 盛普尔D.
        • 弗莱彻S.J.
        • o'neal M.C.
        • Cai Y.
        • chang j.c.j.
        • Broadhurst D.J.
        • Klippsten S.
        • 夏普P.P.
        • Wentell N.A.
        • Kuzuoglu D.
        • 王H.Y.
        • Trenker R.
        • 年轻的杨梅。
        • Cavero D.A.
        • jiatt J.
        • 罗斯T.L.
        • rathore u.
        • Subramanian A.
        • noack j.
        • Hubert M.
        • stroud r.m.
        • Frankel A.D.
        • 罗森伯格O.S.
        • 易怒K.A.
        • agard d.a.
        • ot.T M.
        • emerman m.
        • 汝拉N.
        • von zastrow m.
        • verdin E.
        • Ashworth A.
        • Schwartz O.
        • D'Enfert C.
        • Mukherjee S.
        • 雅各布森M.
        • Malik H.S.
        • 富士岛D.G.
        • IDEKER T.
        • Craik C.S.
        • 地板S.N.
        • 弗雷泽J.s.
        • 总j.d.
        • 萨利A.
        • 罗斯B.L.
        • Ruggero D.
        • 拖船J.
        • Kortemme T.
        • Beltrao P.
        • Vignuzzi M.
        • García-sastre A.
        • Shokat K.m.
        • Shoichet B.K.
        • krogan n.j.
        SARS-COV-2蛋白质相互作用图揭示了药物重新施加的目标。
        自然。 2020;
        • Bojkova D.
        • 克兰克。
        • koch b.
        • videra M.
        • krause d。
        • CIESEK S.
        • Cinatl J.
        • Münchc.
        SARS-COV-2感染宿主细胞的蛋白质组学显示治疗靶标。
        自然。 2020;
        • 沉B.
        • yi x.
        • 太阳y.
        • Bi X.
        • 杜杰克
        • 张C.
        • Quan S.
        • 张F.
        • 太阳r.
        • 钱L.
        • GE W.
        • 刘W.
        • 梁S.
        • 陈H.
        • 张Y.
        • 李杰。
        • 徐J.
        • 他Z.
        • 陈B.
        • 王J.
        • 燕H.
        • 郑扬。
        • 王D.
        • 朱茹
        • 孔Z.
        • 康Z.
        • 梁X.
        • 丁X.
        • 阮G.
        • Xiang N.
        • CAI X.
        • 高H.
        • Li L.
        • 李S.
        • 萧Q.
        • lu t.
        • 朱y
        • 刘H.
        • 陈H.
        • 郭t.
        Covid-19患者血清的蛋白质组学和代谢组特征。
        细胞。 2020;
        • Messner C.B.
        • Demichev V.
        • Wendisch D.
        • Michalick L.
        • 白云
        • Freiwald A.
        • Textoris-taube K.
        • vernardis s.i.
        • Egger A.S.
        • Kreidl M.
        • Ludwig D.
        • 克里安C.
        • Agostini F.
        • Zelezniak A.
        • Thibeault C.
        • Pfeiffer M.
        • Hippenstiel S.
        • 赫卡A.
        • von卡尔c.
        • 坎贝尔A.
        • 海沃德C.
        • Porteous D.J.
        • Marioni R.E.
        • Langenberg C.
        • Lilley K.S.
        • kuebler w.m.
        • MüllederM.
        • 德尔森丁
        • Witzenrath M.
        • Kurth F.
        • 桑德兰。
        • Ralser M.
        超高通量临床蛋白质组学揭示了Covid-19感染的分类器。
        细胞系统。 2020;
        • Hoffmann M.
        • Kleine-Weber H.
        • 施罗德S.
        • Krügern.
        • Herrler T.
        • Erichsen S.
        • Schiergens T.S.
        • Herrler G.
        • wu n.-h.
        • nitsche a。
        • MüllerM.A.
        • 德尔森丁
        • Pölmanns。
        SARS-COV-2细胞条目取决于ACE2和TMPRSS2,并通过临床验证的蛋白酶抑制剂堵塞。
        细胞。 2020; 181: 271-280
        • ZOLG D.P.
        • Wilhelm M.
        • 是的。
        • knaute t.
        • Zerweck J.
        • 文字H.
        • reimer u.
        • Schnatbaum K.
        • Kuster B.
        ProCAL:一组40个保留时间索引,柱性能监测和碰撞能量校准的肽标准。
        蛋白质组学。 2017; 17: 1700263
        • eScher C.
        • 重新勒
        • 麦克莱恩B.
        • Ossola R.
        • 赫罗特F.
        • 谢尔顿J.
        • maccoss m.j.
        • rinner o.
        使用IRT,归一化的保留时间,用于更具靶向肽的测量。
        蛋白质组学。 2012; 12: 1111-1121
        • Dagley L.F.
        • infusini G.
        • 拉森r.h.
        • Sandow J.J.
        • Webb A.I.
        用于自下而上和自上而下的蛋白质组学的通用固相蛋白质制剂(USP3)。
        J.蛋白质组。 2019; 18: 2915-2924
        • 休斯C.S.
        • Moggridge S.
        • MüllerT.
        • Sorensen P.H.
        • Morin G.B.
        • Krijgsveld J.
        蛋白质组学实验的单罐,固相增强的样品制备。
        NAT。 protoc。 2019; 14: 68-85
        • Zecha J.
        • Satpathy S.
        • kanashova t.
        • Avanessian S.C.
        • kane m.h.
        • 克劳瑟K.R.
        • Mertins P.
        • carr s.a.
        • Kuster B.
        TMT.标记为群众:稳健且具有成本效益的内容标签方法。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2019; 18: 1468-1478
        • carr s.a.
        • Abbatiello S.E.
        • Ackermann B.L.
        • 博赫斯C.
        • Domon B.
        • 德意曲e.w.
        • 授予R.P.
        • Hoofnagle A.N.
        • HüttenhainR.
        • Komen J.m.
        • Liebler D.C.
        • 刘涛。
        • 麦克莱恩B.
        • MANI D.R.
        • 曼斯菲尔德E.
        • Neubert H.
        • Paulovich A.G.
        • 重新勒
        • Vitek O.
        • Aeberberold R.
        • 安德森L.
        • 贝瑟姆R.
        • Blonder J.
        • Boja E.
        • Botelho J.
        • Boyne M.
        • Bradshaw R.A.
        • 伯灵名A.L.
        • 陈德。
        • Keshishian H.
        • Kuhn E.
        • kinsinger c.
        • Lee J.S.H.
        • 李S. -W.
        • 莫里茨R.
        • OSS-Prieto J.
        • rifai n。
        • 里奇J.
        • Rodriguez H.
        • srinivas p.r.
        • Townsend R.R.
        • van Eyk J.
        • Whiteley G.
        • Wiita A.
        • Weintraub S.
        生物学和药物中的靶向肽测量:使用拟合方法的质谱法的质谱型测定显影的最佳实践。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2014; 13: 907-917
        • Abbatiello S.
        • Ackermann B.L.
        • 博赫斯C.
        • Bradshaw R.A.
        • carr s.a.
        • Chalkley R.
        • 崔m.
        • 德意志E.
        • Domon B.
        • Hoofnagle A.N.
        • Keshishian H.
        • Kuhn E.
        • Liebler D.C.
        • Maccoss M.
        • 麦克莱恩B.
        • MANI D.R.
        • Neubert H.
        • 史密斯D.
        • Vitek O.
        • Zimmerman L.
        发布原稿的新准则,了解肽和蛋白质靶向质谱测量的开发和应用。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2017; 16: 327-328
        • 麦克莱恩B.
        • Tomazela d.m.
        • 舒尔曼N.
        • Chambers M.
        • 芬尼G.L.
        • Frewen B.
        • 肯尼尔·
        • Tabb D.L.
        • Liebler D.C.
        • maccoss m.j.
        天际线:用于创建和分析目标蛋白质组学实验的开源文档编辑器。
        生物信息学。 2010; 26: 966-968
        • Gessulat S.
        • 施密特T.
        • ZOLG D.P.
        • 萨马拉斯诗
        • Schnatbaum K.
        • Zerweck J.
        • knaute t.
        • rechenberger J.
        • Delanghe B.
        • Huhmer A.
        • reimer u.
        • ehrlich h.-c.
        • Aiche S.
        • Kuster B.
        • Wilhelm M.
        PRITITION:深受深度学习的肽串联质谱的蛋白质组预测。
        NAT。方法。 2019; 16: 509-518
        • 沙姆达五。
        • eCkels J.
        • 席克宁B.
        • Ludwig C.
        • Jaffe J.D.
        • maccoss m.j.
        • 麦克莱恩B.
        Panorama Public:用于在天际线处理的定量数据集的公共存储库。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2018; 17: 1239-1244
        • 卞Y.
        • 郑R.
        • 拜耳F.P.
        • 黄C.
        • chang y.-c。
        • 孟康
        • ZOLG D.P.
        • Reinecke M.
        • Zecha J.
        • Wiechmann S.
        • Heinzlmeir S.
        • Scherr J.
        • 磨风B.
        • Baynham M.
        • Gingras A.-​​C.
        • Boychenko O.
        • Kuster B.
        通过微流量LC-MS / MS为数千蛋白质组的鲁棒,可再现和定量分析。
        NAT。安排。 2020; 11: 157
        • Mcalister G.C.
        • Nusinow D.P.
        • Jedrychowski M.P.
        • wührm.
        • Huttlin E.L.
        • 埃里克森B.K.
        • RAD R.
        • 哈斯W.
        • Gygi S.P.
        MultiToTCH MS3能够通过癌细胞系蛋白质组精确,灵敏和多重检测差异表达。
        肛门。化学。 2014; 86: 7150-7158
        • Tyanova S.
        • Temu T.
        • Cox J.
        基于质谱的霰弹枪蛋白质组学的MaxQuant计算平台。
        NAT。 protoc。 2016; 11: 2301-2319
        • Finkel Y.
        • Mizrahi O.
        • Nachshon A.
        • Weingarten-Gabbay S.
        • Yahalom-Ronen Y.
        • 塔米尔H.
        • ACHDOUT H.
        • MELAMES S.
        • Weiss S.
        • israely t.
        • 帕兰德
        • Schwartz M.
        • 斯特恩吉扎尔N.
        SARS-COV-2的编码能力。
        生物XIV。 2020;
        • SchwanhäusserB.
        • 巴士D.
        • 李恩
        • Dittmar G.
        • Schuchhardt J.
        • 狼J.
        • 陈W.
        • Selbach M.
        哺乳动物基因表达控制的全局量化。
        自然。 2011; 473: 337-342
        • Cox J.
        1D和2D注释富集:一种与互补高通量数据相结合定量蛋白质组学的统计方法。
        BMC生物信息学。 2012; 13: S12
        • Sungnak W.
        • 黄恩
        • BécavinC.
        • 伯格米
        • 王后
        • Litvinukova M.
        • talavera-lópezc。
        • 妈妈
        • reichart d。
        • Sampaziotis F.
        • WOLLOCK K.B.
        • Yoshida M.
        • 巴恩斯J.L.
        • HCA肺生物网络
        SARS-COV-2进入因子在鼻上皮细胞中高度表达以及先天的免疫基因。
        NAT。 Med。 2020; 26: 681-687
        • 王克。
        • 陈W.
        • 周Y.S.
        • 连J.-Q.
        • 张Z.
        • 杜P.
        • 锣鼓。
        • 张Y.
        • Cui H.-Y.
        • Geng J.-J.
        • 王B.
        • 太阳x.-x.
        • 王C.-f.
        • 杨X.
        • 林P.
        • 邓y.-q.
        • 魏D.
        • 杨X.-M.
        • 朱y.-m.
        • 张克。
        • 郑Z.-h.
        • Miao J.-L.
        • 郭t.
        • 施y.
        • 张继夫
        • 傅L.
        • 王Q.-Y.
        • 卞H.
        • 朱诗
        • 陈Z.-n.
        SARS-COV-2通过新型路线:CD147-Spike蛋白侵入宿主细胞。
        生物XIV。 2020;
        • 臧R.
        • Gomez Castro M.F.
        • McCune B.T.
        • 曾Q.
        • rothlauf p.w.
        • Sonnek n.m.
        • 刘Z.
        • Brulois K.F.
        • 王X.
        • 格林伯格H.B.
        • 金刚石M.S.
        • Ciorba M.A.
        • whelan s.p.j.
        • 丁S.
        TMPRSS2和TMPRS4促进人类小肠肠细胞的SARS-COV-2感染。
        SCI。免疫素。 2020; 5: EABC3582.
        • 周L.
        • NIU Z.
        • 江X.
        • 张Z.
        • 郑扬。
        • 王Z.
        • 朱y
        • GAO L.
        • 王X.
        • 太阳Q.
        通过ACE2,TMPRS2和Furin蛋白酶的蛋白质单细胞RNA分析潜在地易受SARS-COV-2感染的组织细胞的系统性分析。
        生物XIV。 2020;
        • thao t.t.n.
        • Labroussaa F.
        • 埃伯特N.
        • v'kovski p.
        • 斯达尔H.
        • Portmann J.
        • 凯莉J.
        • 施泰纳斯。
        • Holwerda M.
        • Kratzel A.
        • Gultom M.
        • Schmied K.
        • Laloli L.
        • HüserL.
        • 宽米
        • Pfaender S.
        • 赫斯D.
        • cippàv.
        • Crespo-Pomar S.
        • SchröderS.
        • muth d.
        • Niemeyer D.
        • Corman V.
        • MüllerM.A.
        • 德尔森丁
        • Dijkman R.
        • Jores J.
        • Thiel V.
        使用合成基因组学平台快速重建SARS-COV-2。
        自然。 2020;
        • 沃伦W.C.
        • Jasinska A.J.
        • García-pérezr.
        • Svardal H.
        • Tomlinson C.
        • Rocchi M.
        • archidiacono n。
        • Capozzi O.
        • Minx P.
        • montague m.j.
        • Kyung K.
        • 希尔利埃尔。
        • Kremitzki M.
        • 坟墓t.
        • 清C.
        • 休斯J.
        • tran n ..
        • 黄扬
        • Ramensky V.
        • choi o. -w。
        • jungy.j.
        • 施密特C.A.
        • 牧师N.
        • Wasserscheid J.
        • 特纳。
        • Wiseman R.W.
        • TUSCHER J.J.
        • Karl J.A.
        • Schmitz J.E.
        • Zahn R.
        • O'Connor D.H.
        • 雷德蒙德E.
        • Nisbett A.
        • Jacquelin B.
        • Müller-trutwin M.C.
        • 布利安利准
        • 二酮M.
        • 安东尼奥米
        • Schroth G.P.
        • Kaplan J.R.
        • Jorgensen M.J.
        • 托马斯G.W.C.
        • 哈恩姆。
        • Raney B.J.
        • 阿肯B.
        • nag r.
        • Schmitz J.
        • Churakov G.
        • NOLL A.
        • 塞尼昂R.
        • 韦伯D.
        • thibaud-nissen f.
        • 北堡M.
        • Marques-Bonet T.
        • 杜瓦尔K.
        • Weinstock G.M.
        • 威尔逊r.k.
        • 自由人n.b.
        长臂猿的基因组(Chlorocebus Aethiops Sabaeus)。
        Genome Res。 2015; 25: 1921-1933
        • Osada N.
        • Kohara A.
        • 雅基T.
        • Hirayama N.
        • Kasai F.
        • Sekizuka T.
        • Kuroda M.
        • 汉纳达K.
        非洲绿色猴子肾衍生Vero细胞系的基因组景观。
        DNA Res。 2014; 21: 673-683
        • Bilinska K.
        • Jakubowska P.
        • Von Bartheld C.S.
        • but
        SARS-COV-2进入蛋白,ACE2和TMPRS2的表达,在嗅觉上皮细胞中:鉴定细胞类型和随龄趋势的趋势。
        ACS Chem。 Neurosci。 2020; 11: 1555-1562
        • 陈L.
        • 李X.
        • 陈米
        • 冯Y.
        • 熊C.
        人体中的ACE2表达表明患有SARS-COV-2感染的患者心脏损伤的新潜在机制。
        Cardiovasc。 res。 2020; 116: 1097-1100
        • Wilhelm M.
        • Schlegl J.
        • Hahne H.
        • GOLYMI A.M.
        • Lieberenz M.
        • Savitski m.m.
        • Ziegler E.
        • Butzmann L.
        • Gessulat S.
        • 马克思H.
        • Mathieson T.
        • Lemeer S.
        • Schnatbaum K.
        • reimer u.
        • 文字H.
        • Mollenhauer M.
        • Slotta-huspenina J.
        • Boese J.-H.
        • Bantscheff M.
        • Gerstmair A.
        • FAERBER F.
        • Kuster B.
        群体蛋白质组的质谱。
        自然。 2014; 509: 582-587
        • 萨马拉斯诗
        • 施密特T.
        • Frejno M.
        • Gessulat S.
        • Reinecke M.
        • Jarzab A.
        • Zecha J.
        • Mergner J.
        • Giansanti P.
        • ehrlich h.-c.
        • Aiche S.
        • 排名J.
        • Kienegger H.
        • Krcmar H.
        • Kuster B.
        • Wilhelm M.
        PROTEOMICSDB:生命科学研究的多OMICS和多生物资源。
        Nucl。酸res。 2019; 48: D1153-D1163
        • Hikmet F.
        • MéarL.
        • UhlénM.
        • Lindskog C.
        人组织中ACE2的蛋白质表达谱。
        生物XIV。 2020;
        • Aguiar J.A.
        • tremblay b.j.-m.
        • 曼斯菲尔德M.J.
        • 伍迪奥。
        • LOBB B.
        • Banerjee A.
        • Chandiramohan A.
        • Tiessen N.
        • Dvorkin-gheva A.
        • revill s.
        • 米勒姆。
        • Carlsten C.
        • 器官L.
        • 约瑟夫C.
        • 约翰A.
        • 汉森P.
        • 麦克马斯勒光明
        • Jenkins G.
        • 苔藓k.
        • 问K.
        • doxey a.c.
        • Hirota J.A.
        基因表达及候选SARS-COV-2受体的原位蛋白质分析在人气道上皮细胞和肺组织中。
        生物XIV。 2020;
        • 格雷纳L.
        • Gallais F.
        • Pible O.
        • 盖尔德J.-C.
        • Gouveia D.
        • Batina H.
        • Bazaline N.
        • 瑞阿特S.
        • 截图K.
        • Miotello G.
        • Debroas S.
        • roncato m.a.
        • Steinmetz G.
        • Foissard C.
        • DESPLAN A.
        • Alpha-Bazin B.
        • Almunia C.
        • 煤气F.
        • Bellanger L.
        • armengaud J.
        SARS-COV-2感染细胞的霰弹枪蛋白质组学及其在疫苗中优化整个病毒颗粒抗原产生的应用。
        生物XIV。 2020;
        • 丁Z.
        • Gillespie L.L.
        • Mercer F.C.
        • Paterno G.D.
        人体MI-ER1的SANT领域与SP1相互作用以干扰GC盒识别并从其自身的启动子抑制转录。
        J. Biol。化学。 2004; 279: 28009-28016
        • Palazon A.
        • Goldrath A.W.
        • Nizet V.
        • 约翰逊R.S.
        HIF转录因子,炎症和免疫力。
        免疫。 2014; 41: 518-528
        • Stukalov A.
        • Girault V.
        • 草五。
        • Bgerent V.
        • Karayel O.
        • 城市C.
        • 哈斯D.A.
        • 黄扬
        • Oubraham L.
        • 王A.
        • 哈马德三
        • Piras A.
        • Tanzer M.
        • 汉森
        • Engleitner T.
        • Reinecke M.
        • 雷帕
        • Ehmann R.
        • Wölfelr.
        • Jores J.
        • Kuster B.
        • 爆发盒U.
        • RAD R.
        • Ziebuhr J.
        • Thiel V.
        • Scaturro P.
        • Pichlmair A.
        多级蛋白质组学显示SARS-COV-2和SARS-COV的宿主扰动策略。
        生物XIV。 2020;
        • 夜莺K.
        • 林K.-M.
        • Ravenhill B.J.
        • 戴维斯C.
        • nobre l.
        • 展示C.A.
        • Ruckova E.
        • Fletcher-Etherington A.
        • Soday L.
        • Nichols H.
        • Sugrue D.
        • 王e.c.y.
        • 莫雷诺P.
        • umrania y.
        • Huttlin E.L.
        • Antrobus R.
        • 戴维森A.J.
        • Wilkinson G.W.G.
        • Stanton R.J.
        • Tomasec P.
        • 周为M.P.
        人巨细胞病毒感染期间宿主蛋白稳定性的高清分析显示抗病毒因素和病毒逃避机制。
        细胞宿主微生物。 2018; 24: 447-460
        • Savitski m.m.
        • Zinn N.
        • Faelth-Savitski M.
        • Poeckel D.
        • 格拉德斯。
        • 那就是我
        • Muelbaier M.
        • 瓦格纳A.J.
        • 斯特拉姆K.
        • Werner T.
        • 梅尔赫特S.
        • Petretich M.
        • Rutkowska A.
        • vapiani J.
        • 弗兰肯H.
        • Steidel M.
        • 甜蜜曼
        • 吉兰奥。
        • lam e.y.n.
        • 道森M.A.
        • prinjha r.k.
        • Grandi P.
        • 贝格明·戈尔
        • Bantscheff M.
        多路复用蛋白质组动力学分析显示控制蛋白质稳态的机制。
        细胞。 2018; 173: 260-274
        • Zecha J.
        • 孟康
        • ZOLG D.P.
        • 萨马拉斯诗
        • Wilhelm M.
        • Kuster B.
        肽级别周转测量能够研究蛋白质形式动力学。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2018; 17: 974-992
        • Ogando N.S.
        • Dalebout T.J.
        • Zevenhoven-Dobbe J.C.
        • Limpens R.W.
        • van der meer y.
        • Caly L.
        • 司令J.
        • de Vries J.J.C.
        • Kikkert M.
        • BárcenaM.
        • Sidorov I.
        • Snijder e.j.
        SARS-CORONAVIRUS-2在VERO E6细胞中的复制:复制动力学,快速适应和缩细胞病。
        生物XIV。 2020;
        • ortea我
        • Bock J.-o.
        通过影响途径分析和网络分析再分析SARS-COV-2感染宿主细胞蛋白质组学时间课程数据。具有炎症反应的潜在联系。
        生物XIV。 2020;
        • rahaman m.m.
        • 驯鹿F.G.
        • Koes D.
        • nguyen a.t.
        • mutchler s.m.
        • Sparacino-Watkins C.
        • alvarez r.a.
        • 米勒M.P.
        • 诚变。
        • 陈B.B.
        • 杰克逊e.k.
        • Camacho C.J.
        • 施特拉姆A.C.
        丙基硫嘧啶的结构引导化学修饰揭示了细胞色素B5还原酶3的新型小分子抑制剂,其提高了一氧化氮生物利用度。
        J. Biol。化学。 2015; 290: 16861-16872
        • Böslk.
        • Ianevski A.
        • 而不是t.t.
        • 安德森P.I.
        • Kuivanen S.
        • Teppor M.
        • Zusinaite E.
        • 倾卸美国。
        • Vitkauskiene A.
        • Cox R.J.
        • Kallio-Kokko H.
        • Bergqvist A.
        • Tenson T.
        • 优点A.
        • oksenych V.
        • BjøråsM.
        • Antononsen M.W.
        • 舒姆D.
        • Kaarbøm.
        • VAPALAHTI O.
        • Windisch M.P.
        • Superti-Furga G.
        • Snijder B.
        • Kainov D.
        • kandasamy r.k.
        通过集成网络分析显示病毒 - 主机交互的常见节点。
        正面。免疫素。 2019; 10: 2186
        • 李杰。
        • 郭米
        • 天X.
        • 刘C.
        • 王X.
        • 杨X.
        • 吴P.
        • 萧Z.
        • qu y.
        • 尹y.
        • 傅J.
        • 朱诗。
        • 刘Z.
        • 彭C.
        • 朱T.
        • 梁Q.
        来自Covid-19患者PMBCS的病毒 - 宿主互联体和蛋白质组学调查揭示了影响SARS-COV-2发病机制的潜在毒力因子。
        生物XIV。 2020;
        • 梅纳弗
        • Giombini E.
        • AgraTi C.
        • 瓦尔托F.
        • Bartoli T.A.
        • Moghazi S.A.
        • Piacentini M.
        • Locatelli F.
        • Kobinger G.
        • Maeurer M.
        • Zumla A.
        • Capbianchi M.R.
        • 劳里亚F.N.
        • IPPolito G.
        Covid-19:基于网络方法模型分析的病毒宿主互联体,以研究SARS-COV-2感染的发病机制。
        生物XIV。 2020;
        • Vandelli A.
        • 蒙蒂M.
        • 米兰纳蒂e。
        • Rupert J.
        • Zacco E.
        • Bechara E.
        • Ponti R.D.
        • Tartaglia G.G.
        SARS-COV-2的结构分析及人偶联的预测。
        生物XIV。 2020;
        • 安德森J.S.
        • Wilkinson C.J.
        • 市长T.
        • Mortensen P.
        • nigg e.a.
        蛋白质相关性分析蛋白质组学表征人中子组。
        自然。 2003; 426: 570-574
        • dunkley t.p.j.
        • Watson R.
        • 格里芬J.L.
        • Dupree P.
        • Lilley K.S.
        通过同位素标记(LOPIT)通过细胞器蛋白的定位。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2004; 3: 1128-1134
        • 布兰森T.C.
        • 博世J.A.
        • 桑切斯A.D.
        • Udeshi N.D.
        • Svinkina T.
        • carr s.a.
        • 费尔德曼J.L.
        • perrimon n。
        • ting a.y.
        活细胞和涡轮增殖症生物的高效邻近标记。
        NAT。 Biotechnol。 2018; 36: 880-887
        • roux k.j.
        • 金D.I.
        • 伯克B.
        • 可能是D.G.
        Bioid:蛋白质 - 蛋白质相互作用的筛选。
        Curr Protoc蛋白质SCI。 2018; 91 (19.23.1-15)
        • 赫苏尔米
        • Bludau I.
        • Rosenberger G.
        • Hafen R.
        • 弗兰克米
        • Banaei-esfahani A.
        • van derogen A.
        • 柯林斯B.C.
        • Gstaiger M.
        • Aeberberold R.
        由SEC-SWATH-MS以复杂为中心的蛋白质组分析。
        摩尔。系统。 BIOL。 2019; 15: e8438
        • Bezstarosti K.
        • Lamers m.m.
        • Haagmans B.L.
        • demmers j.a.a.
        用于检测SARS-COV-2蛋白的靶向蛋白质组学。
        生物XIV。 2020;
        • 戴维森A.D.
        • 威廉姆森M.K.
        • 刘易斯S.
        • Shoemark D.
        • Carroll M.W.
        • Heesom K.
        • Zambon M.
        • ellis J.
        • 刘易斯P.A.
        • hiscox j.a.
        • 马修D.A.
        使用直接RNA测序和串联质谱法的SARS-COV-2转录组和蛋白质组的表征揭示了在除去紫猴的裂解位点的穗糖蛋白中诱导框架内缺失的细胞通道的证据。
        生物XIV。 2020;
        • ihling C.
        • Tänzlerd。
        • 哈吉曼S.
        • kehlen A.
        • Hüttelmaiers。
        • SINZ A.
        Covid-19患者漱口液样品SARS-COV-2蛋白的质谱鉴定。
        生物XIV。 2020;
        • Nikolaev E.
        • Indeykina M.
        • Brzhozovskiy A.
        • Bugrova A.
        • Kononikhin A.
        • Starodubtseva N.
        • Petrotchenko E.
        • Kovalev G.
        • 博赫斯C.
        • Sukhikh G.
        通过核衣壳N蛋白的感染患者鼻咽上皮刮SARS-COV-2病毒的质谱检测。
        生物XIV。 2020;
      1. Morais Cardozo,KH,Lebkuchen,A.,Goncalves Okai,G.,Schuch,Ra,Viana,LG,橄榄,An,Dos Santos Lazari,C.,Fraga,AM,Granato,C.和Carvalho,VM,( 2020)在临床样品中通过串联质谱法快速和低成本检测SARS-COV-2肽。在研究方面提供。

        • 陕西A.
        • Supekar N.T.
        • Gleinich A.S.
        • Azadi P.
        推导出新型冠状病毒SARS-COV-2的穗蛋白的N-和O-糖基化谱。
        糖生物学。 2020;
        • Watanabe Y.
        • 艾伦J.D.
        • 格兰德
        • McLellan J.S.
        • Crispin M.
        SARS-COV-2 Spike的特异性糖类分析。
        科学。 2020; (EABB9983.)
        • 陕西A.
        • Archer-Hartmann S.
        • Supekar N.T.
        • Gleinich A.S.
        • heiss c.
        • Azadi P.
        SARS-COV-2人受体血管紧张素转化酶2的N-和O-糖基化的综合表征。
        生物XIV。 2020;
        • 太阳Z.
        • k.
        • 张X.
        • 陈杰。
        • 江泽民
        • 江j。
        • 济F.
        • 欧阳X.
        • Li L.
        新兴冠状病毒HcoV-19穗蛋白和人ACE2的质谱分析显示伪装聚糖和独特的翻译后修饰。
        生物XIV。 2020;
        • Appelberg S.
        • Gupta S.
        • Ambikan A.T.
        • Mikaeloff F.
        • Végváriá。
        • AkusjärviS.S.
        • 本食学r.
        • Sperk M.
        • Ståhlbergm.
        • 克里希南S.
        • 辛格克。
        • Penninger J.M.
        • Mirazimi A.
        • Neogi U.
        通过SARS-COV-2感染细胞的PROFEO-Transcriptomics鉴定的MTOR / HIF-1信号传导中的呼吸困难。
        生物XIV。 2020;
        • 康y.-l.
        • chouy.y.
        • rothlauf p.w.
        • 刘Z.
        • SOH T.K.
        • Cureton D.
        • 案例J.B.
        • 陈里。
        • 金刚石M.S.
        • whelan s.p.j.
        • Kirchhausen T.
        抑制pikfyve激酶可防止EBOV和SARS-COV-2感染。
        生物XIV。 2020;
        • 克兰克。
        • Bojkova D.
        • Tascher G.
        • CIESEK S.
        • Münchc.
        • Cinatl J.
        生长因子受体信号传导抑制可防止SARS-COV-2复制。
        生物XIV。 2020;
        • Mokuda S.
        • Tokunaga T.
        • Masumoto J.
        • Sugiyama E.
        血管紧张素转换酶2,SARS-COV-2受体通过在类风湿性臂上的STAT3信号传导通过Inter Sele突蛋白-6来上调。
        生物XIV。 2020;
        • Tuttle K.D.
        • minter r.
        • Waugh K.A.
        • araya p.
        • Ludwig M.
        • SEMPECK C.
        • 史密斯K.
        • andrysik z.
        • Burchill M.A.
        • Tamburini B.A.J.
        • orlicky d.j.
        • 沙利文K.D.
        • espinosa -J.M.
        JAK1抑制阻断致命性无菌免疫应答:对Covid-19治疗的影响。
        生物XIV。 2020;
        • Vanderheiden A.
        • RALFS P.
        • Chirkova T.
        • Upadhyay A.A.
        • Zimmerman M.G.
        • Bedoya S.
        • Aoued H.
        • 塔尔普。
        • Pellegrini K.L.
        • 洛根A.C.
        • Menachery V.D.
        • 安德森L.J.
        • Grakoui A.
        • Bosinger S.E.
        • Suthar M.S.
        I型和III型IFN限制人类气道上皮培养的SARS-COV-2感染。
        生物XIV。 2020;
        • 煮熟K.L.
        • WärriA。
        • soto-pantoja d.r.
        • Clarke P.A.
        • Cruz M.I.
        • Zwart A.
        • 克拉克
        羟基氯喹抑制自噬在ER +乳腺癌中具有缓解反应性。
        临床。癌症res。 2014; 20: 3222-3232
        • Schrezenmeier E.
        • Dorner T.
        羟基氯喹和氯喹的作用机制:风湿病学的影响。
        NAT。 Rev. Rheumatol。 2020; 16: 155-166
        • Slater A.f.
        • Cerami A.
        新型丙醇聚合酶酶活性抑制疟疾滋养色素抑制作用。
        自然。 1992; 355: 167-169
        • MédardG.
        • Pachl F.
        • Ruprecht B.
        • Klaeger S.
        • Heinzlmeir S.
        • 掌舵D.
        • 乔H.
        • ku x.
        • Wilhelm M.
        • Kuehne T.
        • 吴Z.
        • Dittmann A.
        • HOPF C.
        • Kramer K.
        • Kuster B.
        激酶抑制剂分析的优化化学蛋白质组学测定。
        J.蛋白质组。 2015; 14: 1574-1586
        • Savitski m.m.
        • Reinhard f.b.m.
        • 弗兰肯H.
        • Werner T.
        • savitski m.f.
        • Eberhard D.
        • 马丁内斯莫里纳D.
        • Jafari R.
        • dovega r.b.
        • Klaeger S.
        • Kuster B.
        • Nordlund P.
        • Bantscheff M.
        • 德鲁斯G.
        通过蛋白质组的热分析跟踪活细胞中的癌症药物。
        科学。 2014; 346: 1255784
        • 斯科珀斯。
        • Kahraman A.
        • Leuenberger P.
        • 冯Y.
        • Piazza I.
        • MüllerO.
        • Boersema P.J.
        • Picotti P.
        测量蛋白质结构变化对蛋白水解耦合质谱法的蛋白质组规模的变化。
        NAT。 protoc。 2017; 12: 2391-2410
        • 李克。
        • Vaudel M.
        • 张B.
        • ren y.
        • 温B.
        PDV:综合蛋白质组学数据观众。
        生物信息学。 2019; 35: 1249-1251
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