关于可信度,清晰度和合规性

      自成立以来,MCP已经认识到蛋白质组学的承诺及其潜在的 技术要大大移动生物学和医学知识的界限。 As has been noted (
      • Bradshaw R.A.
      • 伯灵名A.L.
      技术创新重新审视。
      ),蛋白质组学代表了如何设计和执行实验的范式转变 以及如何解释和存储所得到的数据。但本期刊也得到了认可 蛋白质组学方法的价值和产生的数据只是良好 作为该数据的质量和可靠性“计算格言的推论, “垃圾进垃圾出。”因此,在其最早的阶段,编辑人员 MCP,特别是Steve Carr,Ruedi Aeberberold和Al Burlingame,开始认真 讨论期刊如何评估大规模的数据的评估 称为“霰弹枪”,质谱实验,最终导致第一个 set of guidelines (
      • 卡车。
      • Aeberberold R.
      • Baldwin M.
      • 伯灵名A.
      • 克劳瑟K.
      • Nesvizhskii A.
      在发布肽和蛋白质识别数据的情况下需要指导方针: 肽和蛋白质识别数据的出版指南工作组。
      )。最初,这些问题集中在正确鉴定肽序列(如 蛋白质的替代品衍生自源自),但迅速扩展到鉴定 与翻译后修改(PTM)和基于质量光谱的定位 量化也是如此(
      • Bradshaw R.A.
      • 伯灵名A.L.
      • 卡车。
      • Aeberberold R.
      蛋白质识别:好的,坏的和丑陋。
      ,
      • Bradshaw R.A.
      • 伯灵名A.L.
      • 卡车。
      • Aeberberold R.
      报告蛋白质识别数据:下一代指南。
      )。主要是,决定提交给期刊的稿件应提供 足够的信息,以便由第一审查员进行适当的评估 读者。首先,所请求的信息由用于集合的方法组成 和数据的解释(基本上搜索参数)以及标识 他们自己。随着指引,介绍了教程和清单 帮助提交过程。后者最终扩展到包括清单 对于临床相关论文和报告糖类分析的论文(
      • Celis J.E.
      • carr s.a.
      • Bradshaw R.A.
      临床蛋白质组学手稿的新准则。
      ,
      • 井L.
      • 哈特G.W.
      糖类:建立蛋白质组学以推进糖类课程。
      )。最后,首次介绍了指南后简单地作为建议, 期刊开始通过使所有提交的文章进行审查来确定以确定以确定 如果他们是符合要求的。合规检查不是,而且从来没有意味着,一个 部分评估对等审查过程,因为这些检查只确定是否 已经提供了必要的信息,并不以任何方式评估其质量 or interpretation.

      参考

        • Bradshaw R.A.
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        技术创新重新审视。
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        • 卡车。
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        • Baldwin M.
        • 伯灵名A.
        • 克劳瑟K.
        • Nesvizhskii A.
        需要在肽和蛋白质识别数据的出版中的指导方针:肽和蛋白质识别数据的出版指南上的工作组。
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        • Bradshaw R.A.
        • 伯灵名A.L.
        • 卡车。
        • Aeberberold R.
        蛋白质识别:好的,坏的和丑陋。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2005; 4: 1221-1222
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        • 伯灵名A.L.
        • 卡车。
        • Aeberberold R.
        报告蛋白质识别数据:下一代指南。
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        用于开放访问数据的质谱数据质量指标的建议(对阿姆斯特丹原则的必然结果)。
        摩尔。细胞。蛋白质组学。 2011; 10MO111.015446
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