通过毛细管流动数据无关的采集型蛋白质组学分析1508次血浆样品的体重减轻和维护'[S]

      综合,高通量分析等离子体蛋白质组有潜力 启用个人健康状况的整体分析。根据我们自己的经验 与近期大规模等离子体质谱(MS)的蛋白质组评价 研究,我们确定了两个出色的挑战:慢且精细的纳米流动液体 色谱法(LC)和IrreRoDuciety的识别数据依赖性收购 (DDA)。我们确定了最佳解决方案,以强大的毛细管流降低这些限制 数据无关的采集(DIA)MS。该平台可以测量31种血浆蛋白质 每天。使用此设置,我们获得了对饮食,肥胖的大规模等离子体研究 和基因膳食(DiOgenes)包含1508个样品。证明稳健性, 在单个分析栏中实现了完整的收购。完全,565个蛋白质 (用两种或更多种肽序列鉴定的459),用74%的数据集进行了分析 完整性。平均每次收购确定了408个蛋白质(5246肽) (319例蛋白质在所有收购的90%中)。评估工作流再现性 使用定期收购的34个质量控制池,导致92%的数据 用CVS设置完整性,用于蛋白质测量为10.9%。
      20载脂蛋白的曲线可以是揭示不同的变化。这 减肥和重量维持导致对低级炎症的持续影响, 以及类固醇激素和脂质代谢,表明有益效果。比较 对于其他大规模的等离子体体重减轻研究表明了高稳健性和质量 发现生物标志物候选人。跟踪非酶糖甘露化表明a 延迟,重量维持阶段的糖化略微减少。使用稳定的同位素参考, 我们可以直接且绝对量化在DIA中的60例蛋白。
      总之,我们在本文中存在第一个大规模的血浆直接研究和其中一个 迄今为止最大的临床研究蛋白质组学研究。快速应用 鲁棒的工作流程具有很大的潜力,可以推进等离子体中的生物标志物发现。

      图形概要

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