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有限微观蛋白质组样品中蛋白水解蛋白质族的敏感性测定* [S]

  • 塞缪尔S.H.翁
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    加拿大温哥华大学哥伦比亚大学病理学与实验室医学系

    迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划,BC儿童医院,加拿大温哥华
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  • Fatih Demir.
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    中央工程研究所,电子和分析,ZEA-3,ForschungszentrumJülich,德国
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  • Enes K. Ergin.
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    加拿大温哥华大学哥伦比亚大学病理学与实验室医学系

    迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划,BC儿童医院,加拿大温哥华
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  • Sabrina dirnberger
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    中央工程研究所,电子和分析,ZEA-3,ForschungszentrumJülich,德国
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  • Anuli Uzozie.
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    加拿大温哥华大学哥伦比亚大学病理学与实验室医学系

    迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划,BC儿童医院,加拿大温哥华
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  • 多伦米奇的tuscher.
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    中央工程研究所,电子和分析,ZEA-3,ForschungszentrumJülich,德国
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  • Lorenz Nierves
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    加拿大温哥华大学哥伦比亚大学病理学与实验室医学系

    迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划,BC儿童医院,加拿大温哥华
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  • Janice Tsui.
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    加拿大温哥华大学哥伦比亚大学病理学与实验室医学系

    迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划,BC儿童医院,加拿大温哥华
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  • Pitter F. Huesgen.
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    中央工程研究所,电子和分析,ZEA-3,ForschungszentrumJülich,德国

    科隆卓越群体在德国科隆科隆大学医疗教师和大学医院老龄化相关疾病中的细胞应激反应
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  • Philipp F. Lange.
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    加拿大温哥华大学哥伦比亚大学病理学与实验室医学系

    迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划,BC儿童医院,加拿大温哥华
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  • 作者脚注
    *这项工作是由加拿大癌症协会(授予704831),Michael Cuccione基金会和BC儿童医院基金会(对PFL)以及欧洲联盟地平线提供资金的开始赠款2020计划(授予639905,PFH)。 A.U.,L.N.和e.k.e.来自迈克尔·卢西奥氏儿童癌症研究计划或BC儿童医院研究所的奖学金支持。 p.f.l.由加拿大研究椅计划和迈克尔史密斯卫生研究学者计划提供支持。作者声明没有竞争利益。
    [S] 本文含有补充材料。
    **这些作者平等贡献。
      蛋白质n termini明确识别截短的,或者翻译或修改 具有不同功能的蛋白质Oforms,揭示疾病的扰动。可选择的 富集N-末端肽是为了实现蛋白质组的覆盖 无偏见的特异性调节蛋白水解加工和蛋白酶的鉴定 基板。然而,许多蛋白水解过程严格限制在时间和 因此,只能在提供不足的微小样品中分析空间 用于当前富集协议的起始材料。在这里,我们提出了高效 基于未甲板的N末端浓缩(HUNTER),坚固,灵敏和可扩展的方法 用于分析先前无法访问的微观样本。猎人达到了识别 of >从小至2μg原始Hela细胞裂解物的1000 n末端。广泛的适用性 通过对分类的人原发性免疫细胞的第一个N-末端分析证明 并富集小儿癌患者的线粒体分数,以及蛋白酶 来自个体的基材识别 拟南芥蒂利亚纳 野生型和真空加工酶缺陷型突变幼苗。我们进一步实施了 液体处理系统上的工作流程,并证明了临床的可行性 来自小儿癌患者的液体活组织检查自动化的降级。

      图形概要

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