Scopus(2004)

TRIS,pH 9.0和0.5米

WDR9基因和蛋白质产品在小鼠发育过程中的表达。
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    室温下碳酸氢铵15分钟。用50米洗涤凝胶片

    ,Smyd2作为DNA损伤反应基因的潜在作用通过与P53和Prkdc等基因的相互作用。
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    室温下碳酸氢铵15分钟。用50米洗涤凝胶片

    ,Smyd2作为DNA损伤反应基因的潜在作用通过与P53和Prkdc等基因的相互作用。
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  • 图缩略图GR1.
    森塔米。
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    ,Smyd2作为DNA损伤反应基因的潜在作用通过与P53和Prkdc等基因的相互作用。
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  • 尖关液M.
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    室温下碳酸氢铵15分钟。用50米洗涤凝胶片
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  • )。我们表明了这一点
    森塔米。
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    ,Smyd2作为DNA损伤反应基因的潜在作用通过与P53和Prkdc等基因的相互作用。
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  • 戈德伯格D.S.
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    显示通过半定量RT-PCR显示野生型Smyd2及其设定结构域缺失突变体的表达水平。 GAPDH用作内部控制。
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    室温下碳酸氢铵15分钟。用50米洗涤凝胶片

    ,Smyd2作为DNA损伤反应基因的潜在作用通过与P53和Prkdc等基因的相互作用。
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  • 摩尔。 BIOL。细胞。
    SMYD2的过表达导致表达与染色质重塑,细胞周期和转录调节相关的基因的表达。 SMYD2调节的大多数基因与H3K4甲基化同意上调。由Smyd2过表达上调的染色质重塑的蛋白质的实例是SWI / SNF复合物的三种蛋白质()和塔塔结合蛋白相关因子TAF10由人体SET7 / 9( 马德森C..
    )。我们也观察到了上调的 http://www.mcponline.org文章标题,摘要,关键词
    LSD1去甲基化抑制组蛋白标记以促进雄激素受体依赖性转录。
    ,半定量RT-PCR分析的表达水平
      体外。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加体内,而未检测到任何可观察的H3K36水平。我们还报告称,功能的SMYD2的增益与37个和下调四种基因的上调,其中大多数参与细胞周期,染色质重塑和转录调节。Tacc2.是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调Tacc2.是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调Tacc2.是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调通过含有迷你完全蛋白酶抑制剂混合物的RIPa缓冲液中的裂解细胞制备总细胞蛋白。在4-12%SDS-PAGE凝胶(NUPAGE,NOVEX,SAN DIEGO,CA)上分离蛋白质,然后转移到硝酸纤维素膜中。使用单克隆辣根过氧化物酶 - 缀合的小鼠抗标旗M2抗体(Sigma)进行SMYD2及其突变体的蛋白质印迹分析。通过兔多克隆抗体检测H3甲基化赖氨酸,用于单,二甲基化的Lys-4(Upstate Cell信号传导溶液,Plapid,NY)。使用从升上的upstate细胞信号传导溶液购买的小鼠单克隆抗体检测HSP90α蛋白。使用从Calbiochem和Absova(Jhongli City,Taoyuan,Taoy,Taoyuan,Taoynou,Taokwan)购买的小鼠单克隆抗体检测P53和EBP41L3。兔IgG被用作阴性对照,并从西格玛购买。然后用辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG或山羊抗小鼠中学抗体(Dako Cytomation Inc.,Mississauga,安大略省,加拿大)探测膜。
      CentroSomal蛋白CG-NAP和KENDRIN通过锚固γ-管蛋白环络合物提供微管成核位点。
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      用SMYD2-调节的基因的SMYD2相互作用和蛋白质产品组合
      当前的卷
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      • jenuwein t.
      • COLE P.A.
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      将模拟控制和免疫沉淀的SMYD2从293T细胞中加入到其中
      ,
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      • 杨杰。
      • DEDWEL H.S.
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      • 穆斯克特B.
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      • 戈德伯格D.S.
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      是指使用来自293个细胞的抗标绳抗体的免疫沉淀蛋白。这
      dtt。将反应混合物在30℃温育3小时,温和混合。通过闪烁计数测量甲基转移酶活性。为了测量H3K4特异性活性,将SMYD2与15μ孵育
      )。用模拟抗体(小鼠IgG)的IP用作阴性对照,表明在该实验中获得的PCR产物特异于Smyd2的存在。我们的数据表明SMYD2与启动子区域绑定 SEDTA和1%Triton X-100),含有蛋白酶抑制剂(Mini完整,Roche诊断)的混合物在4℃下30分钟。通过在4℃下以14,000rpm离心10分钟,除去细胞碎片。然后将上清液能够用琼脂糖珠粒,在4℃下摇动2小时。除去琼脂糖珠,并用预制抗标志M2亲和力凝胶替换,并在4℃下在振荡器中孵育过夜。然后用洗涤缓冲液洗涤珠子五次(50米
      1)。用模拟抗体(小鼠IgG)的IP用作阴性对照,表明在该实验中获得的PCR产物特异于Smyd2的存在。我们的数据表明SMYD2与启动子区域绑定 SEDTA和1%Triton X-100),含有蛋白酶抑制剂(Mini完整,Roche诊断)的混合物在4℃下30分钟。通过在4℃下以14,000rpm离心10分钟,除去细胞碎片。然后将上清液能够用琼脂糖珠粒,在4℃下摇动2小时。除去琼脂糖珠,并用预制抗标志M2亲和力凝胶替换,并在4℃下在振荡器中孵育过夜。然后用洗涤缓冲液洗涤珠子五次(50米
      体外甲基化测定以验证HSP90α是否影响Smyd2作为甲基转移酶的活性和特异性。使用抗标志抗体短暂地将Smyd2免疫沉淀,并将免疫沉淀物与重组组蛋白H3和具有或不具有Hsp90α的Adomet孵育。蛋白质在SDS-PAGE上分离并用抗组蛋白H3抗体免疫印迹(
      • 亚当斯S.L.
      • Scopus(74)
      ISG20L2,一种涉及核糖体生物发生的新型脊椎动物核核苷酸酶*
      使用的缩写是:IP-HTM,免疫沉淀,耦合高吞吐量MS; Smyd2,含有含Mynd的蛋白2;设置,Su(var)3-9,增强子和曲折。 mynd,myeloid,nerm和deaf-1; Adomet,
      • Semerra R.
      • 贾斯汀N.
      • 博克恩。
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      由核胺氧化酶同源物LSD1介导的组蛋白去甲基化。
      ,
      • III,R.J.>III, R.J.
      • pn和Δgee.
      • Groosveld F.
      在与SMYD3认可的网站不同的网站。
      MicroArray数据在访问号下提交到ArrayExpress S由芯片4跨越区域的启动子序列(
      • shanks r.a.
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      • Semerra R.
      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      ,
      • 太阳J.
      • 格兰德维克
      • 李恩
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      • 要求
      p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
      组蛋白甲基化与基因表达的调节有关。特别地,H3K4的甲基化通常与基因表达的激活有关(
      • shanks r.a.
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      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      ,
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      p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
      ,
      • 史密斯G.D.
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      )。除了它们在组蛋白甲基化中的功能之外,还显示含有设定结构域的蛋白质对甲基化非组蛋白蛋白。该活性的实例是p53的甲基化(
      在文章中查看 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 转化含酸性卷绕线圈的蛋白4与Centrosomal Akap350和有丝分裂主轴装置相互作用。
      • shanks r.a.
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      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      ,
      • 太阳J.
      • 格兰德维克
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      p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
      - 甲基转移酶特别prmt3和-5)( 李H.好的
      • 史密斯G.D.
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      )。除了它们在组蛋白甲基化中的功能之外,还显示含有设定结构域的蛋白质对甲基化非组蛋白蛋白。该活性的实例是p53的甲基化(
      比率 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 站点导向诱变 -
      • 史密斯G.D.
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      • 安慰剂B.J.
      )。除了它们在组蛋白甲基化中的功能之外,还显示含有设定结构域的蛋白质对甲基化非组蛋白蛋白。该活性的实例是p53的甲基化(
      其他交互取决于设定域的活动。例如,通过缺失两种设定域共识序列来消除了P53和SMYD2之间的相互作用(
      • 在文章中
      • orstavik s.
      • shanks r.a.
      • 自然。
      • 联系
      • pn和Δgee.
      • 斯图尔特二,
      • 追求C.
      • 泰勒P.
      • Scopus(279)
      • DORSEY J.A.
      • Groosveld F.
      是输入全细胞裂解物的蛋白质印迹分析(
      )。 SMYD3和SUV39H1在其设定域中有两个保守区域Δnhsc
      • 隶属关系
      • 脚注
      • 孟德利
      • 体内
      • NAT。方法。
      赖氨酸乙酰化和溴琼瓜:一种用于信令的新伙伴关系。
      Smyd2设定结构域在其甲基转移酶活性的作用 -
      • 在文章中
      • orstavik s.
      • shanks r.a.
      • 自然。
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      • pn和Δgee.
      • 斯图尔特二,
      • 追求C.
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      是输入全细胞裂解物的蛋白质印迹分析(
      ©2008 ASBMB。目前由elsevier公司发布;最初由美国生物化学协会发表的生物化学和分子生物学。
      • 张某。
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      • Berriz G.f.
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      • 麦金尼K.
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      两个域的故事 - 分子
      Smyd2及其突变体的甲基化活性显示在设定结构域的两个保守序列中的点突变后其活性降低。缺失MyND结构域似乎不会影响Smyd2的组蛋白甲基化活性。
      • 张某。
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      两个域的故事 - 分子
      - [.
      。待考虑数据库中肽中最逻辑的逻辑分配。此外,当肽与多于一个数据库进入相匹配时,仅考虑了最高评分蛋白质。在阴性对照芯片-HTM中观察到的所有蛋白质从SMYD2芯片-HTM中减去。因此,仅在补充表1A中报道了SMYD2芯片HTM实验中观察到的蛋白质。除HSP90α中有补充表1A中报道的所有蛋白质都有一个蛋白质匹配,其具有多种同种型。 HSP90α的同种型在补充表1a(gi:83699649)中是具有最多唯一肽匹配的匹配。 tScopus(120) a分享 c权限c创建一个免费帐户是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调)。观察到其他微管相关的蛋白质,包括轴和TTK,已知在微管动态中发挥作用。 TTK本地化为中心组,已知磷酸化物
      • 张某。
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      两个域的故事 - 分子
      对于除了它含有两个进化节保守的结构域(MyND和设定结构域)的Smyd2,甲酸盐P53,并且甲基化物组合物H3在Lys-36处致甲基化物。因此,SMYD2的蛋白质组学和基因组学研究可能会提高我们对其分子作用的理解。

      见文章

       Scopus(2060)

      通过从转染的细胞中提取的RNA上的半定量RT-PCR测量。如图所示2 )。由于最近的报告显示通过组蛋白甲基化(以下)表明SMYD1,-2和-3对照基因表达(

       有针对性的蛋白质组学

      使用cDNA微阵列测量由SMYD2过度引起的基因表达的变化。用SMYD2或模拟载体转染约80%汇合的人293T细胞。 24小时后,收获细胞并在液氮中冷冻。根据制造商的协议(QIAGEN),使用RNEASY试剂盒从293T细胞中提取总RNA。用DNase处理总RNA样品以去除潜在的基因组DNA污染。使用免疫细胞化学与与FITC缀合的抗标绳抗体的免疫细胞化学确定转染效率高于95%。在多伦多微阵列中心派遣样品进行分析。两个不同的mRNA样品(样品

       经常问的问题

      甲基化测定,我们进行了染色质IP实验,以研究通过SMYD2结合的DNA附近的组蛋白修饰。然而,除了基因芯片之后,我们进行了凝胶电泳和蛋白质印迹分析,以寻找在组蛋白H3上的赖氨酸甲基化的富集。在293T细胞中,短暂的野生型Smyd2和Δnhsc和Δnhsc和Δgee缺失突变体在293t细胞中单独过表达,使用交联剂来固化相互作用,将细胞裂解物超声处理以降低DNA的大小,并使用抗标志抗体净化Smyd2及其相关蛋白质。使用针对单 - ,二 - 和三甲基化的H3K4或二甲基化H3K36的抗体分析显示,染色体IP对野生型SMYD2特异性富集甲基化H3K4但不是二甲基化的H3K36(

       林Y.W.

      显示用于输入DNA的PCR扩增产物作为引物的PCR扩增控制。
      • 帮助n.r.
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      用SMYD2-调节的基因的SMYD2相互作用和蛋白质产品组合
      )。相反,即使在长时间暴露后,均未在Smyd2甲基化中检测到甲基化的H3K36(数据未显示)。此外,用两种结构结构域缺失突变体进行的染色质IP显示H3K4的富集(2 用模拟对照,野生型Smyd2,ΔnHSC或ΔGee转染约80%汇合的人293T细胞24小时。收获细胞并在液氮中冷冻。根据制造商的协议(QIAGEN),使用RNEASY套件提取总RNA。用DNase处理总RNA样品以去除潜在的基因组DNA污染。使用符号RT-PCR试剂盒(Bio-rad)使用半定量RT-PCR测量基因表达水平。使用的底漆是:7 真核DNA双链断裂修复的机制。m 补充材料m NaCl, 1 mm )。这些蛋白质 - 蛋白质相互作用数据和基因表达数据显示SMYD2可能在Centosomal MT动态中具有重要作用。也观察到与SMYD2缔合的其他蛋白质也表明SMYD2在微管动态中的作用。特别地,Clasp2(细胞质接头相关蛋白2)是哺乳动物MT加端结合蛋白,它与EB1和MT结合。它介导MT Plus End和Cell Cortex之间的相互作用(m 10.1074 / MCP.M700271-MCP200m ,富集Smyd2蛋白质相互作用伙伴到Centrosome;锚定到中心体的蛋白质可能在Centrosomal微管动态和细胞周期调节中具有作用。

       奥尔森e.n.

      在标志蛋白洗脱之前在珠子上在珠粒上进行甲基化测定。将细胞裂解物与抗标志M2亲和性凝胶一起温育后,洗涤珠子以除去非特异性结合蛋白。将含有标记标记蛋白质的珠子与1.65μCI混合m)。这些结果进一步证实了m 补充材料m NaCl, 1 mm 生物化学系,微生物学和免疫学,渥太华大学,渥太华,安大略省K1H 8M5,加拿大 g 使用越来越多的Hsp90α重组蛋白组蛋白甲基化测定。这表明SMYD2需要HSP90α的活动。m 通过赖氨酸甲基化调节P53活性。m Tris, pH 8.0, 1 mm NaF, and 1 mm 如果您不记得密码,可以通过输入电子邮件地址并单击“重置密码”按钮重置它。然后,您将收到一封包含用于重置密码的安全链接的电子邮件 g NIMA相关激酶2(NEK2),一种局部化为CENTOSOMES的细胞周期调节的蛋白激酶,对蛋白质磷酸酶1络合。

       图形查看器(在新标签中打开)

      编码位于中心组体的A-kinase锚固蛋白的cDNA的克隆与表征,Akap450。m 两个域的故事:Smyd2的蛋白质组学和基因组学分析,一种新的组蛋白甲基转移酶*m )。设定结构域是一种由130-140氨基酸组成的进化保守的序列基序。它的名称来自三种蛋白质,其中它最初表征:su(var)3-9,Zeste的增强子和曲折(m DTT and 50 mm SMYD2的IP-HTMS实验是以前发表的大规模报告的一部分进行的(m 下载Hi-Res Imagem 互动仪中的P图案是一个很好的预测因子,即MyND域发生的交互。m 微阵列施加到电离辐射响应的显着性分析。m 。 (1)使用IP-HTM和我们的改进的芯片HTMS方法,如“材料和方法”所述。m 蛋白质序列,因为使用人细胞进行实验。肽和MS / MS质量分别分别设定为±2和0.8DA,允许一种切错一次。离子分数截止为30用于接受单个MS / MS光谱。基于ELIAS的报告选择此阈值
      数据表明,在没有HSP90α的情况下,SMYD2对二甲基化Lys-36具有一些弱的活性。 Lys-36甲基化与棕色报道的数据一致18 )。 SMYD2具有由Interpro数据库预测的类似TPR样域。我们假设HSP90α的SMYD2激活可以通过其TPR结构域介导。该TPR样结构域可以通过与其设定结构域结合而作为SMYD2活性的抑制剂。类似于PPP5,可以通过TPR结构域发生与HSP90α的SMYD2相互作用,导致SMYD2甲基化活性的增强。在这个阶段,需要进一步的工作来验证这个假设。18 由微阵列数据生成的Unigene列表和交互映射生成的蛋白质名称被导入了路径Studio 5.0。本文挖掘软件使用由科学摘要组装的分子网络数据库和手动策划的同义词词典来识别生物术语(
      )。 Hsp90α作为Smyds的辅助因子有贡献的方式仍然不清楚。 HSP90与其结合伴侣之间有趣的相互作用通过四肽重复(TPR)结构域来介导;例如,其与蛋白质磷酸酶5的相互作用(PPP5)( 施密特P.H. *这项工作部分由加拿大研究主席,加拿大卫生研究院(CIHR),MDS Inc.,安大略基因组学院和渥太华大学。本文的出版费用部分按付款方式部分支付。因此,本文必须根据18 U.S.c,标明“广告”。第1734节仅表明这一事实。 威治E.K. Smyd2主要是甲基化物H3K4。我们建立了与P53等基板的SMYD2相互作用取决于设定域。我们的基因组学实验表明,SMYD2过表达导致37个基因的上调,参与染色质重塑,细胞周期和转录调节 李H.好的
      • 亚伯拉罕C.
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      56℃下碳酸氢铵15分钟。然后用100μm烷基化游离巯基组
      肿瘤抑制剂DAL-1 / 4.1b以底物特异性方式调节蛋白质精氨酸N-甲基转移酶5活性。 MB)甘氨酸。然后使用抗标志M2亲和凝胶免疫沉淀样品。使用以下引物检查感兴趣的DNA的启动子序列是否被拉下来。用于PCR扩增的引物是:TACC2芯片1 F,5'-aaccaatcagcggcactc; TACC2 CHIP1 R,5'-TTCTTCATAGCACTTACAATGACC; TACC2 CHIP2 F,5'-GGCTAAAGGGATAGGTGGA; Tacc2芯片2 R,5'-Gcacagtgactcatgcctgt; TACC2 CHIP3 F,5'-CCCGACCTGAAAGTTGCTAT; TACC2 CHIP3 R,5'-CTTATCAGGAAGCGGCTGAC; Tacc2 Chip4 F,5'-GatctCagGagttgggcaAg;和tacc2 chip4 r,5'-agcggggtgacttgagaaatc。

       )。这也是SMYD1的情况

      关于含有和Mynd的蛋白质2(Smyd2),Smyd蛋白质家族的成员很少。然而,由于最近的报告表明SMYD2甲酸盐P53和组蛋白H3,因此对更好地理解SMYD2的作用的兴趣已经增长。在这项研究中,我们介绍了SMYD2的组合蛋白质组学和基因组学研究,旨在阐明其分子作用。我们使用与高通量MS,染色质免疫沉淀的免疫沉淀的组合报告SMYD2的细胞骨和核酰蛋白组,染色质免疫沉淀与高通量MS,以及共免疫沉淀方法。特别是,我们将SMYD2与HSP90α独立于集合和MyND域与HSP90α进行交互,通过MyND域,通过集合域和P53使用P53。我们证明,SMYD2与HSP90α的相互作用增强了赖氨酸4(H3K4)的组蛋白H3的Smyd2组甲基转移酶活性和特异性

       向Daniel Fige发送电子邮件

      重印 蛋白质序列在包含国家生物技术信息(NCBI)的国家中心(NCBI)前进和逆向数据库(2007年1月发布)使用吉祥物数据库搜索引擎版本2.1.0.4(矩阵科学,波士顿,MA)作为消化酶,氨基甲酰基甲酰化半胱氨酸作为固定改性,甲硫氨酸氧化为可变改性。搜索仅限于 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 ,只有野生型形式有能力增加 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 ‖由加拿大老龄化调查员奖的支持。 重印 。蛋白质组学和基因组学数据的组合表明了相互作用和表达水平的可能反馈机制和组合调节。最后提供的数据将极大地有助于我们对SMYD2和SMYD蛋白质的理解。 S新浪微博l在 .楚P.-3改性染色质IP显示在Smyd2与DNA的粘合附近的体内增加H3K4甲基化 - m 进一步验证我们的m 用迷你完全蛋白酶抑制剂混合物钠)钠。将蛋白质沉淀在每个脉冲之间的冰上以至少1分钟超声处理三次。然后将裂解物以13,000×离心m ),由于Smyd2在其靶基因的启动子区域中的Smyd2至甲基化物H3K4的能力而发生。我们还表明SMYD2与P53结合,最近发现由SMYD2甲基化(

       然后我们测试了SMYD2是否受调

      本研究提出了SMYD2的分子作用的组合基因组学和蛋白质组学研究。使用互乱映射方法,我们确定了新型SMYD2相互作用伙伴,并证明了SMYD2中的两个结构域(MyND和Set)在介导这些相互作用中的作用,特别是与EBP41L3,HSP90α和P53的相互作用。此外,我们展示SMYD2在HSP90α存在下作为H3K4甲基转移酶作用于H3K36甲基转移酶,在没有HSP90α的情况下。基因表达研究表明,293T细胞中的功能的Smyd2增益主要导致基因表达的上调。芯片数据表明,下游基因的激活,例如 窦z. - 壬基甲基硫氨酸;芯片 - HTM,染色质免疫沉淀加上高吞吐量MS; TACC2,转化,含酸性卷绕线圈的蛋白2; AA,氨基酸; SAM,微阵列的重要性分析; NT,核苷酸; TPR,硫酸四肽重复; PPP,蛋白质磷酸酶; CHD9,Chromodomain Helicase DNA结合蛋白9; mt,微管; akap,a-kinase锚定蛋白; GAPDH,甘油醛-3-磷酸脱氢酶; SWI / SNF,开关/蔗糖均为可疑。2 ratio >免费注册用户名和密码

       在sciencedirect上访问本文

      设定结构域是已知的组蛋白赖氨酸甲基转移酶结构域。 Smyd2中该结构域的存在表明该蛋白质作为组蛋白甲基转移酶的潜在作用。 SMYD2(SMYD3和SMYD1)的两种同源物具有H3K4的甲基转移酶活性(m Smyd2朝向组蛋白H3的甲基转移酶活性取决于Hsp90α的存在。进行第二组实验以使用针对单 - ,二 - 或三甲基化H3K4的抗体确定甲基化位点的特异性。在短的曝光实验中,没有Hsp90α没有观察到Lys-4或Lys-36的甲基化活性(补充图1)。将重组Hsp90α添加在Lys-4处引起Smyd2至甲基化组蛋白H3。在放射缩影膜的短暂暴露后,易于检测H3K4甲基化(

       蛋白质组学识别

      用Cy3或Cy5染料标记模拟控制,并对含有19,008个特征和未知的人表达序列标签的单个斑点的人19K阵列(H19K)进行共杂交。基因表达分析一式三份完成。由SAM软件分析生成的数据以产生统计上大量的命中。 SAM软件显示报告的基因是统计学上的显着性,并被过滤以消除具有对数值的绝对值的所有基因 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 Tris-HCl,pH 7.4和150米 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 要了解Smyd2在细胞中的作用,我们使用两种方法映射了互乱。第一种方法,被称为IP-HTMS,查看了SMYD2的全局互动者(
      为了全球理解SMYD2蛋白质 - 蛋白质相互作用如何影响基因表达,我们将蛋白质相互作用数据与由Smyd2上调的基因的蛋白质产物与具有生物信息学工具的基因的蛋白质产品组合。组合Pathway Studio中的数据允许我们搜索网络中组合数据的交互伙伴,并找到直接链接和实体之间的最短路径(

       )表明SMYD2二甲酯Lys-36的H3而不是Lys-4,虽然它们

      (补充图2)。如补充表3所示,其中一些基因在染色质重塑中以及细胞周期和转录调节中起作用。我们的数据表明,SMYD2过表达将导致基因表达的总体激活与观察到的SMYD2的H3K4甲基化活性一致。
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      ,饼图显示在293T细胞在293T细胞中过表达在瞬态转染后293T细胞中的过表达后表达改变的基因的分类,与用模拟载体转染的细胞相比。基因根据其功能分为四类:转录,染色质重塑,细胞周期等。 Fig. 7 - [.
      下载.pdf(1.03
      Fig. 7P图案(补充表2)。以前证明了人蛋白BS69的MyND结构域与含有MOTIF P的蛋白质结合A版权所有©2021美国生物化学和分子生物学协会。由elsevier公司发布代表美国生物化学和分子生物学协会。版权所有。 BH]甲硫氨酸(PerkinElmer Life Sciences),4μg鸡肉核心组蛋白,1.5μgHSP90α(Calbiochem)50米

      英语

      )。为了测试SMYD2的MYND结构域是否是与EPB41L3的相互作用所必需的,在EPB41L3和野生型或MYND缺失形式的SMYD2和SET缺失之间进行共同IP测定。如图所示
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      )。有趣的是发现21种蛋白质中的五种与smyd2相互作用具有p
      使用单,二 - ,三甲基化H3K4抗体的甲基化测定。发现SMYD2的野生型和Mynd缺失突变体对甲酸甲酯H3K4,而删除GEE或NHSC序列使SMYD2无效。

       组蛋白赖氨酸甲基化的许多面孔。

      ,还称为染色质相关的间充质调节剂,已知与甲基化的组蛋白H3结合。通过SMYD2过表达抑制的另一个基因是
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      用SMYD2-调节的基因的SMYD2相互作用和蛋白质产品组合
      )。因此,我们建议SMYD2当与HSP90α结合特异性甲酸盐H3K4并主要导致基因表达的激活。我们还表明,在没有HSP90α的情况下,SMYD2对甲基化物H3K36具有一定程度的活性,这可能导致基因抑制。 Fig. 1 黄杰。
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      用SMYD2-调节的基因的SMYD2相互作用和蛋白质产品组合
      )。我们研究了SMYD2对基因表达水平过表达的影响。简短的野生型Smyd2在293T细胞中过表达,并将提取的总RNA与使用微阵列用嘲弄载体转染的细胞提取的RNA(参见“材料和方法”)。根据SAM软件,共有41个基因显示出表达式的统计学显着变化(Fig. 1蛋白质甲基化在转录调节中的作用。
      图缩略图GR4.
      Fig. 1蛋白质组学指纹识别造血干细胞生物学中的发育命运测定和标记发现* 李H.甲基化测定显示Smyd2在Lys-4和Not Lys-36处的Smyd2至甲基化组蛋白H3的能力。在里面 在小鼠卵母细胞减数分裂期间适当的染色质缩合和组蛋白H3磷酸化需要蛋白质磷酸酶活性。
      其组蛋白甲基转移酶活性或间接通过不同的机制进行活性。简要用野生型SMYD2或ΔGEE或ΔNHSC缺失突变体以及模拟控制转染293T细胞。基因表达N,染色体螺旋酶DNA结合蛋白9(
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      蛋白质磷酸酶5的四肽重复结构域介导与糖皮质激素受体杂蛋白的结合,并用作显性负突变体。
      ,
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      显示SMYD2蛋白质 - 蛋白质相互作用伙伴的图,其细胞定位如ewing所识别的
      )。最后,我们使用生物信息学工具显示SMYD2蛋白交流仪是由人类偶联地图中SMYD2靶向的一些基因的蛋白质产品的近邻。这可能表明通过基因表达和蛋白质相互作用表示反馈机制和组合调节。
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      • DORSEY J.A.
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      通过与保守的P结合介导蛋白质 - 蛋白质的相互作用
      ,在SMYD2蛋白交互液列表和由SMYD2上调上调的基因的蛋白质产品之间鉴定了联系。这些蛋白质分为两组( 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 (
      • 尹恩。
      • 图2C.
      • 巴克H.M.
      • 高清K.
      • ROE S.M.
      • 博克恩。
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      • 张继夫
      • 朱L.
      )。因此,我们假设包含p的SMYD2互动者
      第7卷,问题3 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 ,蛋白质印迹显示有同IP测定。瞬时表达野生型Flag-Smyd2及其突变体,内源性EPB41L3和控制IgG从293T细胞提取物免疫沉淀,并探测沉淀物用于免疫沉淀剂(

       蛋白质磷酸酶5是糖皮质激素受体·HSP90配合物的主要成分,其具有FK506结合免疫蛋白的性质。

      染色体IP的Smyd2过表达的富集H3K4甲基化富集。XLX脱胶A.
      • 费用。
      • 6月11日,
      包含CCCTCC图案,其是SMYD3的绑定站点,并在芯片3区域定位(
      发布,MCP纸张,2007年12月7日,DOI 10.1074 / MCP.M700271-MCP200XLX)。自动抑制PPP5的晶体结构显示TPR结构域和磷酸酶催化亚基之间的广泛界面(
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      蛋白质磷酸酶5的四肽重复结构域介导与糖皮质激素受体杂蛋白的结合,并用作显性负突变体。
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      显示SMYD2蛋白质 - 蛋白质相互作用伙伴的图,其细胞定位如ewing所识别的
      )。根据制造商(Invitrogen)的指示,使用Lipofectamine 2000简单地将Smyd2野生型和突变体构建体转化为293t,NiH3T3和HeLa细胞。细胞镀成75厘米 图。 1M-BOP,一种抑制蛋白对心肌生成,与SKNAC相互作用,心脏和肌肉和肌肉特异性转录因子。XLX聋人1,一种新的蛋白质,其在变形的反应元件中结合必要区域。生物信息学。通过Smyd2与促进区中靶基因的启动子区域相关联的能力介导。此外,我们证明SMYD2和SMYD3与相同的启动子区域没有结合 XLX是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调
      图缩略图GR1.
      Fig. 2)。总共发现21种蛋白质与SMYD2相互作用。AP图案,例如EBP41L3,可能与SMYD2的MYND域相互作用。 EBP41L3,也称为DAL-1,已涉及乳腺,肺和脑癌的分子发病机制,并且被认为是肿瘤抑制因素(; 追求C.郝T. 分割C.P. Smyd2,49.7-KDA蛋白质由433个氨基酸组成,是SMYD家族的成员。 SMYD2与其他SMYD家族成员的序列对准揭示了已知具有甲基转移酶活性的地区( B,对FLAG-SMYD2,内源P53和对照IgG进行的类似实验。 P53和Smyd2之间的相互作用未通过MyND结构域介导,如Mynd删除的Smyd2形式的能力所示,以免疫沉淀p53蛋白,反之亦然。 C。这些包括PPP1CA和-B以及AKAP11和-13。通过SMYD2通过PPP1CA的上调来进一步支持到中心体的链接。已显示PPP1CA与NEK2形成复合物,丝氨酸/苏氨酸激酶局部地定位在Centrosome(
      )。将野生型Smyd2及其突变体转染到293T细胞中,使用抗标绳抗体免疫沉淀,并用于氚的甲基转移酶测定图6D.用手术刀切除凝胶带,并置于新鲜的微管中。用50米短暂洗涤凝胶碎片
      )。最后,与SMYD2相互作用的其他蛋白质是PRKDC,其是一种丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶,其用作DNA损伤的分子传感器。 Prkdc还充当支架蛋白,以帮助将DNA修复蛋白定位到损伤部位(基因表达。两个组蛋白甲基转移酶 - 无活性突变体和模拟对照没有增加基因表达

       。这些数据表明SMYD2的甲基化活性直接影响基因表达

      )。这种情况与P53和Smyd2之间的相互作用的性质相关,其中P53用作Smyd2的基材。接触 最佳 2B显示芯片测定和转录开始部位的引物的位置的基因(
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      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      ,
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      p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
      细胞蛋白提取和蛋白质印迹 - 李H.好的
      • 史密斯G.D.
      • III,R.J.>III, R.J.
      • 全文PDF.
      • 安慰剂B.J.
      )。除了它们在组蛋白甲基化中的功能之外,还显示含有设定结构域的蛋白质对甲基化非组蛋白蛋白。该活性的实例是p53的甲基化(
      朝向人蛋白蛋白质相互作用网络的蛋白质组织级映射。 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 搜索本作者的文章
      )。我们的CO-IP数据支持该视图,即SMYD2和EBP41L3之间的交互通过P通过P由MyND域介绍 in 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加结果电子邮件/用户名 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 烧伤在无抗生素培养基中转染前的一天,在转染日中产生80%汇合单层。在转染后,细胞分成两种新烧瓶并留下48小时,达到收获当天的完全汇合。转染48小时后,用冰冷的PBS洗涤细胞两次,然后收获。然后将细胞冷冻在液氮中并储存在-80℃直至准备好使用。使用2×10进行免疫沉淀实验 图6A )。这两个区域也存在于SMYD2的设定结构域中。为了研究设定域中的设定域和Adomet绑定基序的作用,这两个位点(Δnhsc和Δgee)突变(
      显示更多工具菜单
      Fig. 3本文的在线版本(可提供A, 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 )Smyd2的形式以及引入其MyND结构域的突变体以及设定域,Δnhsc和Δgee的两个保守序列。 B, 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 碳酸氢铵溶液,随后在50%乙腈(v / v)和25米的溶液中缩小 追求C.TPR结构域介导的蛋白质磷酸酶5调节的分子基。 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 质谱法的大规模映射人蛋白 - 蛋白质相互作用。 文章 人蛋白 - 蛋白质相互作用网络:用于注释蛋白质组的资源。 ono y。 Smyd2影响基因表达并结合启动子李S. - [. 看法编辑委员会

       通过CO-IP验证SMYD2的一些物理交互。

      ,对FLAG-SMYD2,内源性HSP90α和控制IgG进行的类似实验。 HSP90α和Smyd2之间的相互作用未通过MyND结构域介导,如Mynd删除的Smyd2形式的能力所示,以免疫沉淀Hsp90α,反之亦然。
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      p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
      回购人募集PP1γ至染色质,对细胞活力至关重要。XGroosveld F.DOI:Curr。拍摄。结构。 BIOL。
      • shanks r.a.
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      • Semerra R.
      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      未标记的Adomet和4μg重组组蛋白H3。使用抗单 - ,二 - 和三甲基化的H3K4抗体或二甲基化H3K36(Upstate细胞信号传导溶液)检测H3K4甲基化。rea s..)。此外,我们已经观察到蛋白质WRD9的下调(溴琼域和含有WD重复域1),这已知已知与SMARCA4相互作用(SWI2相关基因1)( 3)以确保MS数据中的假阳性率小于1%。蛋白质达到至少一个“大胆的红肽”所需的蛋白质
      • shanks r.a.
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      • Semerra R.
      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      )。 SMYD2与SMYD3共享31%的序列同一性和52%的序列相似性,这是SMYD家族的另一个成员。 SMYD2和SMYD3的序列同源性主要是由于MyND和设定结构域。第二组(B)包括P53和PRKDC等基因。这些蛋白质之间的联系可能以SMYD2在其对P53的调节中的作用为中心的。 Smyd2甲基化物p53,导致其靶基因的启动子区的解离(在基础水平上方的Lys-36处的任何甲基化。我们的 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 和补充图1)。此外,在没有重组Hsp90α的情况下,Lys-36处的甲基化仅弱观察并且在放射缩影膜的更长的曝光之后(补充图1)。
      图缩略图GR7.
      Fig. 4在其他作品中重用物品的部分或提取物AHSP90α增强了SMYD2甲基转移酶活性。 - [)我们发现与SMYD2互动。也发现AKAP和PPP1系列的其他成员与SMYD2相关联如图所示 B, 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 );上调37个基因,而在Smyd2的过度表达后,仅下调四个基因(补充表3)。微阵列数据的验证是通过半定量的RT-PCR完成的差异表达的基因, C使用先前的方法通过以下底漆对进行验证五个基因的微阵列数据:SMARCA2 F,5'-TCCGAGGCAAATCAGTCAAG; smarca2 r,5'-ttcctcgatttggccttttct; WDR9 F,5'-TTCCAGAGCTCGTGAATCCT; wdr9 r,5'-cggggaccagtttttttttga; BAT1 F,5'-AcagctCTGCTTTCGTGAC; BAT1 R,5'-GCACTCATGCTGGACTTTG; CHD9 F,5'-catctggaaaccgggacagat; CHD9 r,5'-ctgccactgatgcctctat; AKAP13 F,5'-AgttctcttccGCTCCAACA;和Akap13 R,5'-ActcaccaaAccctgaagga。

       室温下碳酸氢铵15分钟。将这些碎片干燥〜10分钟。胰蛋白酶在50米

      elestwier帮助 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 使用Promega Access RT-PCR,根据制造商的议定书(Qiagen,Mississauga,Ontario,Canada),从HEAEASY RNA提取套件从HEAER293T细胞中提取的总RNA扩增全长SMYD2 cDNA。然后将SMYD2 cDNA克隆到定向网关Topo PETR载体(Invitrogen)中。为了将SMYD2 cDNA转移到哺乳动物表达载体中,使用网关™克隆系统。 PETR载体在其5'和3'端上包含ATTL1和ATTL2重组位点。然后利用这两个位点将SMYD2克隆转移到其C末端(ATCC)的含有FLAG标签的哺乳动物表达载体中。使用293T细胞的小批次转染来验证标志-MYD2表达。 图2,B和C.通过进行过表达Smyd2,Smyd2突变体的染色质IP来评估甲基化活性,并通过Western印迹进行随后的分析来测量H3K4甲基化的富集水平(体内 - [.
      图缩略图GR3.
      Fig. 5)。 SWI / SNF复合物通过不同的机制涉及癌症(图3B. )对大型人类蛋白质进行了蛋白质相互作用实验。我们对蛋白质 - 蛋白质相互作用的映射的方法基于免疫沉淀,与高通量MS(IP-HTM)相结合。A荔枝研究杂志BIE追求C.郝T. Doanload .ppt.ppt. in A 最佳 B 用于染色质IP。序列分析显示启动子区域A荔枝研究杂志B - [. 文章 克拉塞斯通过与LL5β的复合物连接微管加上末端到细胞皮质。 侦察 使用组蛋白甲基转移酶测定法李S.创建引文警报(在新标签中打开)

       创造性的公共归因(CC到4.0)

      r,5'-cattgacagggctctcctga; SMYD2 F,5'-TGCAAGCAGGCATTTTTGG; SMYD2 R,5'-TTTCTGTTTGGCAGAATCC; GAPDH F,5'-TGATGACATCAAGAAGGTGGTGAAG;和GAPDH R,5'-TCCTTGGGGCCATGTGGCCAT。
      • 社论
      • Semerra R.
      )通过SMYD2过表达进行上调。
      ,
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      。我们确实确定了下游靶基因的调节
      )。最后,许多已知将DNA结合DNA的锌指蛋白质通过Smyd2上调。 SWI / SNF复数的成员对细胞的染色质重塑作用的um-调节。同样,含溴酰蛋白的蛋白质的下调和含染色体的蛋白质点的上调至潜在的反馈机制,用于组酸酯乙酰化/甲基化。
      • 彼得人A.H.
      • 广告
      • LIM J.
      使用特异性抗体在蛋白质印迹上鉴定测定和甲基化。
      p图案。我们还建立了SMYD2与HSP90α相互作用。我们证明,Smyd2通过其设定结构域作为甲基转移酶,其在不存在Hsp90α的情况下在Hsp90α和甲基化物H3K36存在下特别甲基化物。 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调, WDR9, AKAP13, Bat1)。但是,棕色发布的最近报告CHD9甲基 图2A HSP90α与SMYD2的相互作用通过除Mynd和设定结构域以外的区域介导的,如其与SMYD2缺失突变体相互作用的能力所示。我们发现SMYD2和HSP90α之间的相互作用对于SMYD2的组蛋白甲基转移酶活性与SMYD1和-3(
      P图案也与SMYD2的MyND域交互。除了Mynd结构域之外,设定结构域还似乎在介导一些蛋白质 - 蛋白质相互作用方面很重要。我们认为,设定域中的两个保守区域对于其与P53的相互作用是重要的,其一个基板。 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 特异性组蛋白H3甲基转移酶调节染色质结构。 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 大规模蛋白质组学研究中使用的质谱平台的比较评价。国旗IP..下载数字(PPT) 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 向每个管中加入碳酸氢铵,并将样品置于37℃过夜(12-16小时)进行消化。用5%甲酸(v / v)和50%乙腈(v / v)从凝胶块中萃取肽。然后使用SpeedVac干燥肽溶液并在-20℃下储存直至质谱分析。 国旗IP..是对H3K4甲基化探测的输入全细胞裂解物的蛋白质印迹( 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 请在提交搜索之前输入一个术语。蠕虫U.促进剂甲基化物H3K4。此外,与基因表达数据的SMYD2互蛋白酶的组合表明,SMYD2调节的一些基因与SMYD2相互作用蛋白质密切相关。 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 关于作者Ilona S. Skerjanc的函授信息
      条款和条件
      Fig. 6关于作者Fred Elisma的函授信息 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调.A珠子。使用1-H梯度(用0.1%甲酸5-80%乙腈)洗脱肽,进入LTQ线性离子阱质谱仪(Thermo Electron,Waltham,MA)中。在数据相关的采集模式下获取MS / MS光谱,该模式自动选择并分段为产生的每个MS频谱的五个最强烈的峰值。 B)。启动子的 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 CLASP1和CLASP2与EB1结合并调节细胞皮层的微管加最终动力学。。 ( - [. CDAL-1 / 4.1B肿瘤抑制剂与蛋白质精氨酸N-甲基转移酶3(PRMT3)相互作用,并抑制其在体外和体内甲基化基质的能力。 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 NAT。方法。 梅斯伯格E. HSP90α和SMYD2之间的相互作用改变了SMYD2甲基转移酶活性和特异性 - D关于作者Ashraf S. Al-Madhoun的函授信息 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 SMYD2的MyND域与含PXLXP含有蛋白质和SMYD2的含量通过设定域与其基板相互作用 - Scopus(209) IP-HTM鉴定的SMYD2相互作用伙伴位于核外,而芯片-HTMS相互作用剂位于细胞核中。
      重用已发布的材料的许可 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 )。 EPB41L3与SMYD2的相互作用不受设定域共识序列(NHSC和GEE)的缺失的影响。这清楚地表明SMYD2和EPB41L3之间的相互作用取决于MyND域,并且P 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 ¶安大略省妇女卫生委员会/ CIHR性别和健康奖学金研究所支持。 Embo J.通过SMYD2作为SMYD2结合而发生的 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 SMYD2与HSP90α的相互作用表明HSP90α在SMYD2的功能中起着重要作用。因此我们进行了 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调实验强烈表明H3K4是甲基化的主要位点。我们没有观察 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调.

      联系我们

      )。虽然它需要进一步的实验验证,但使用新的生物信息工具组合我们的蛋白质组学和基因组学数据表明了与支持SMYD2上现有数据的不同蜂窝流程的明确链接,并为理解SMYD2的功能提供新的场所。
      SMYD2和HSP90α之间的相互作用不受任何缺失的影响,提高HSP90α与SMYD2的另一部分或间接通过另一种不受缺失的缺失和设定域的蛋白质相互作用的可能性(XLX加拿大蛋白质组学和系统生物学研究椅。应该解决对应的通信。电话:613-562-5800(ext.8674);传真:613-562-5655XLX
      • 费用。
      • 6月11日,
      包含CCCTCC图案,其是SMYD3的绑定站点,并在芯片3区域定位(
      鉴定SMYD2蛋白质相互作用 - XLX蛋白质 - 蛋白质相互作用的测绘有助于我们理解蛋白质的功能。近年来,我们的小组(
      • III,R.J.>III, R.J.
      • jahnsen t.
      • ), 和
      • Scopus(23)
      • Scopus(188)
      • 全文PDF.
      )。响应DNA损伤,平衡朝向Set7 / 9介导的P53介导的甲基化,其阻断SMYD2甲基化(
      特别是有趣的,因为它是通过TTK磷酸化的(XLX)。该界面包括与HSP90相互作用的TPR结构域的区域,导致作者得出结论,通过将TPR结构域与磷酸酶结构域分离(in)来结束TPR结构域和Hsp90之间的结合来激活PPP5
      • 盛Y.
      • Scopus(159)
      • 西蒙C.
      • 费用。
      • Scopus(25)
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      • 隐藏脚注
      • robb v.a.
      • 中间伙计
      蛋白质磷酸酶5的四肽重复结构域介导与糖皮质激素受体杂蛋白的结合,并用作显性负突变体。
      右心室心脏发育的调节剂,是MEF2C在发育中的直接转录靶标。XLXTTK激酶对于TacC2的中心定位至关重要。XLX;网站:网站:mcpro-site;问题:pii \:pii \:s1535947620x60567; ctype:string:string:resident;文章:pii \:pii \:s1535947620312159; pagegroup:string:page group; wgroup:string:string:迁移的网站;页面:字符串:显示全文;杂志:Journal:McPro; RequestedJournal:Journal:Journal:McPro;产品:产品:产品:产品:产品\:HA
      跨越区域-1279至+130的基因,相对于转录开始部位分为四个区域:芯片1(NT -1279至-949),芯片2(NT -949至-629),芯片3(NT -629至-200)和芯片4(NT -200至+130)。每个区域的特异性引物用于鉴定SMYD2特异性结合的区域(
      • shanks r.a.
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      • Semerra R.
      癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
      ,
      • 太阳J.
      • 格兰德维克
      • 李恩
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      • 要求
      p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
      对于修饰的IP协议,用SMYD2标志或对照载体(空向量)转染的293T细胞在1%甲醛中在37℃下在1%甲醛中交联10分钟。然后通过将甘氨酸加入125米的最终浓度来终止交联反应
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      • 生物信息学。
      • 施密米
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      10分钟。然后使用抗标绳抗体免疫沉淀上清液,并如下所述的质谱法分析。
      ,
      • 施密米
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      • Scopus(86)
      )。与Smyd2相互作用的PPP1cc形成一个叫做雷可蛋白的必需综合体,该蛋白质是募集PPP1至染色质所需的蛋白质(
      ,
      • 图5A
      • 抽象的
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      • 细胞培养-
      • 哈丽斯J.v.
      • 马德森C.
      • RICHTER M.
      Smyd2的蛋白质组学和基因组学分析,一种新的组蛋白甲基转移酶*
      )。这些数据表明,可以通过甲基化激活或抑制p53,如组织蛋白。它还通过其直接甲基化活性来指导SMYD2在肿瘤发生中的潜在作用,该直接甲基化活度调节P53和潜在的其他蛋白质(
      • 施密米
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      • Scopus(86)
      )。与Smyd2相互作用的PPP1cc形成一个叫做雷可蛋白的必需综合体,该蛋白质是募集PPP1至染色质所需的蛋白质(
      在4℃下5分钟去除细胞碎片。将颗粒在1×裂解缓冲液中洗涤三次,然后重新悬浮在RIPA缓冲液中(150米
      • 图5A
      • 抽象的
      • 指导方针
      • 细胞培养-
      • 哈丽斯J.v.
      • 马德森C.
      • RICHTER M.
      Smyd2的蛋白质组学和基因组学分析,一种新的组蛋白甲基转移酶*
      鉴定为SMYD2相互作用伙伴的蛋白质根据其功能分为两组:组蛋白调节和微管动态。前组包括组蛋白H3,组蛋白H4和EPB4113(精氨酸调节器 -
      • 图5A
      • 抽象的
      • 指导方针
      • 细胞培养-
      • 哈丽斯J.v.
      • 马德森C.
      • RICHTER M.
      Smyd2的蛋白质组学和基因组学分析,一种新的组蛋白甲基转移酶*
      ,
      • 陈马
      • 马德森C.
      研究表明,在HSP90α存在下,SMYD1和SMYD3在赖氨酸4(H3K4)下特别是甲酸盐组蛋白(
      ,通过单 - ,二 - 和三甲基化的H3K4特异性抗体检测到野生型Smyd2的H3K4的甲基化。设定结构域突变剥离了Smyd2的甲基化活性。 Mynd结构域缺失对Smyd2的甲基化活性没有任何影响。组蛋白H3用作加载控制。 Coomassie染色的SDS-PAGE凝胶显示出除阳性对照(SET7 / 9)外的不同甲基化反应的同等量的HSP90α。
      通过有限的蛋白水解或多不饱和脂肪酸与TPR结构域的结合激活蛋白质磷酸酶5。
      • 社论
      • Semerra R.
      )通过SMYD2过表达进行上调。
      ,
      • Scopus(195)
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      。我们确实确定了下游靶基因的调节
      SMYD2蛋白质 - 蛋白质相互作用数据与微阵列数据的组合从SMYD2过表达中获得的293T细胞中的两个主要网络重新组合。
      • 社论
      • Semerra R.
      )通过SMYD2过表达进行上调。
      在野生型SMYD2的过表达后,其设定结构域缺失突变体和293T细胞中的模拟对照后转录物。这 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 ,染色质IP的PCR结果仅显示芯片4引物的PCR产物,仅当使用抗标旗-MYD2抗体时,表明SMYD2可以与之结合 李H.好的
      • 史密斯G.D.
      • III,R.J.>III, R.J.
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      • 安慰剂B.J.
      )。除了它们在组蛋白甲基化中的功能之外,还显示含有设定结构域的蛋白质对甲基化非组蛋白蛋白。该活性的实例是p53的甲基化(
      ,二甲基化。 ,而未检测到任何可观察的H3K36水平。我们还报告称,功能的SMYD2的增益与37个和下调四种基因的上调,其中大多数参与细胞周期,染色质重塑和转录调节。 在5%Co中,在37℃下在高葡萄糖Dulbecco的改性鹰培养基中培养293T细胞 ,而未检测到任何可观察的H3K36水平。我们还报告称,功能的SMYD2的增益与37个和下调四种基因的上调,其中大多数参与细胞周期,染色质重塑和转录调节。 - 烷基甲基硫氨酸(Adomet)作为供体基质( 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加 我们提出SMYD2,类似于其他SMYD家族成员,通过与特异性DNA共识位点直接与蛋白质 - 蛋白质与辅因子的相互作用直接结合来调节基因表达。探讨SMYD2对其靶基因的调节区域的结合,启动子区
      • 棕色m.a.
      • Scopus(89)
      • )。这
      • Scopus(25)
      • Scopus(564)
      • 毫米j.
      • 供电
      • shanks r.a.
      • 臭虫
      )。以前的研究表明,Smyd1和-3可以在Hsp90α存在下甲酸盐H3K4(
      )。这种复杂在细胞周期的多个阶段起着重要的作用,包括差异和有丝分裂(
      • 取消
      • 太阳J.
      • P560-572,
      • 安慰剂B.J.
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      • 顶面板
      • Groosveld F.
      • 取消
      )。这些酶将甲基加入组蛋白H3的赖氨酸残留物中使用
      使用Mascot Distiller 2.0.0.0(Matrix Science,UK)从MS / MS,MS / MS .RAW文件生成峰值列表来生产.mgf文件。对于每个MS / MS个单个峰值列表,假设2+和3+充电。然后分析.mgf文件并与248,060匹配
      。 IP-HTM方法的一个限制是对核蛋白的偏差。因此,使用了第二种方法,称为芯片HTM。该方法包括修饰的染色质IP协议(参见耦合到HTM的“材料和方法”),以丰富来自细胞核的SMYD2相互作用伙伴和与DNA结合的SMYD2。芯片-HTMS方法放大了SMYD2核蛋白互动者的名单(
      • Scopus(183)
      • 普拉特W.B.
      SMYD2在基因表达调节中的作用 -
      ,
      • 孟德利
      • demmers J.
      • shanks r.a.
      • 趋势类型。
      SMYD2设定结构域在其甲基转移酶活性的作用。
      )。当不受雄激素受体的约束时,LSD1去甲基化活化组蛋白标记单 - 和二甲基-H3K4(
      • 哈丽斯J.v.
      • 记得我
      • 威治E.K.
      从upstate细胞信号传导解决方案购买的甲基化套件。
      )。染色质IP随后PCR扩增表明SMYD2与此结合
      • Scopus(183)
      • 普拉特W.B.
      SMYD2在基因表达调节中的作用 -
      ,
      • Scopus(122)
      P图案如HSP90α和P53独立于MYND域与SMYD2相互作用(
      潮湿的孵化器。 Dulbecco的改性鹰培养基补充有10%胎牛血清,100μg/ ml青霉素,100μg/ ml链霉素和50μg/ ml抗催化剂。
      • 张继夫
      • demmers J.
      • 摩尔。细胞。
      • Goldening J.R.
      设定域蛋白调节Eu-和异象素的染色质域。
      )。人体SET7 / 9通过LYS-372甲基化稳定P53(
      • 陈米克。
      )。对PPP1CC的抑制导致异常的染色质缩合(
      )。违反了SMYD1和-3,棕色的报道 CHD9通过将肽样品溶解在5%甲酸中来进行LC-MS / MS。将样品注入200μm×5cm的预选内,其中5μmymc ods-a c MEF2CSmyd3编码涉及癌细胞增殖的组蛋白甲基转移酶。
      • TIMM J.
      • 虚拟问题
      • Groosveld F.
      • 安德森J.
      • 全文PDF.
      • 安慰剂B.J.
      • 生物信息学。
      • ) 和别的 (
      • 悬崖M.J.
      不同赖氨酸残基的组蛋白甲基化与激活或基因表达的抑制相关(
      SMYD蛋白质系列由五种蛋白质(SMYD1-5)组成,这些蛋白质(SMYD1-5)没有完全表征并基于两个保守结构域(Mynd和Set Comains)的存在进行分组。 MyND结构域是涉及蛋白质 - 蛋白质相互作用的锌手指基序。它以髓样,神经和聋人1命名,聋人是含有MyND域的三种最表征的蛋白质(
      在用表达模拟载体(PCDNA3.1)的质粒转染的293T细胞的提取物上对甲基化测定进行甲基化测定,野生型SMYD2(PCDNA3.1-FLAG-SMYD2)或SMYD2突变体(PCDNA3.1FLAG-SMYD2ΔGEE,PCDNA3 .1标志 - SMYD2Δnhsc,或pcdna3.1-flag-smyd2δmynd)。然后使用与琼脂糖珠缀合的抗标绳抗体的前述方案免疫沉淀的标志标记的蛋白质。这
      • 生物。
      • 卡希尔D.
      • gamblin s.j.
      • 图2A
      关于作者登录到您的帐户的函授信息
      前帧 Fig. 7NACL)。通过在1×洗涤缓冲液中在4℃下与100μl3×标志肽(150ng /μl)温育30分钟,通过将结合的蛋白质洗脱30分钟。通过如下所述的质谱法分析蛋白质。Fig. 7)。组蛋白H3是用于Smyd2的已知底物。已知与Smyd2相互作用的另一种蛋白质是p53,其最近显示通过Smyd2甲基化。第二组包括CLASP2,与细胞质接头蛋白(夹)相关联的蛋白质结合生长微管的结束(
      • 新内容警报.
      • Scopus(85)
      • 和参考。
      • 巴克H.M.
      • 推特
      • 麦金尼斯W.
      通过Set9介导的甲基化进行TAF10功能的基因特异性调节。
      )。例如,H3K4的甲基化与基因活化有关,而相同组蛋白的Lys-9的甲基化与基因抑制有关(
      • 新内容警报.
      • Scopus(85)
      • 和参考。
      • 巴克H.M.
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      • 麦金尼斯W.
      通过Set9介导的甲基化进行TAF10功能的基因特异性调节。
      我们的蛋白质 - 蛋白质相互作用数据显示HSP90α与SMYD2相互作用;通过CO-IP进一步证实了这一点(
      • 新内容警报.
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      • 巴克H.M.
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      通过Set9介导的甲基化进行TAF10功能的基因特异性调节。
      P图案,如EPB41L3。五个SMYD2互动仪包含p
      • 马德森C.
      • 图4A
      • ) 和别的 (
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      • orkin s.h.
      P图案,包括EPB41L3。选择EPB41L3以进一步验证,因为其在调节精氨酸甲基转移酶3和5中的作用(
      Smyd2的鉴定和表征:含有分裂/ myND域的组蛋白H3赖氨酸36特异性甲基转移酶,其与SIN3组蛋白脱乙酰酶复合物相互作用。
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      • DORSEY J.A.
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      )。 SWI / SNF复合物被募集到染色质以使用ATP水解作为能量来源来改造核桃体(
      ,
      • 张L.V.
      • J.细胞Biol。
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      • eliasj.e.
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      )。已知溴染色瘤与乙酰化组蛋白H3结合(
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      H标记的Adomet和Hsp90α。使用如前所述的闪烁计数器测量甲基化活性(
      三,pH 8.0,1米是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调重新分配或重新发布最终文章 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 路径工作室 - 分子网络的分析与导航。
      • 尹恩。
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      )。因此,我们假设包含p的SMYD2互动者
      )。我们的数据清楚地表明SMYD2在HSP90α存在下特别甲基化H3K4,类似于SMYD1和SMYD3。此外我们 Fig. 7)。此外,缺失Adomet结合共有序列ΔGee或ΔnHSC导致Smyd2甲基化活性的急剧降低,表明两个Adomet结合结构域序列对于Smyd2甲基转移酶活性至关重要(
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      • pn和Δgee.
      • 马德森C.
      )。类似地,SMYD2通过Lys-370的甲基化调节P53活性,抑制p53介导的转录调节(
      使用Agilent 1100微型HPLC系统(Agilent Technologies,Santa Clara,CA),珠子(水域,Milford,MA)。在10μl/ min的10μl/ min的95%水,5%乙腈和0.1%甲酸(v / v)上,将肽在95%水,5%乙腈和0.1%甲酸(v / v)上。然后将流速分裂在捕食前,以​​在柱上产生〜200μl/ min的流速。在从备注中洗脱后,肽被引导至75μm×5cm的分析柱,其用5μmymc ods-a c包装
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      渥太华渥太华大学系统生物学研究所,渥太华,安大略省K1H 8M5,加拿大
      - [.
      )。 HSP90用作PPP5和糖皮质激素受体杂蛋白之间关联的介体。表达的PPP5 TPR结构域用作显性负突变体,强烈抑制糖皮质激素受体介导的转录活化(
      • 张某。
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      两个域的故事 - 分子
      )。参见补充图3,用于银染色的凝胶,显示SMYD2突变体对与其他蛋白质相互作用的影响。
      • 张某。
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      两个域的故事 - 分子
      使用来自Upstate Cell信号传导溶液的染色质IP测定试剂盒进行芯片测定。用Smyd2标志或对照载体转染293T细胞在1%甲醛中交联10分钟。然后通过加入125米终止交联反应
      • 路透社G.
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      Western Blot显示输入全细胞裂解物的分析(
      ,而未检测到任何可观察的H3K36水平。我们还报告称,功能的SMYD2的增益与37个和下调四种基因的上调,其中大多数参与细胞周期,染色质重塑和转录调节。
      )。在这种方法中,标志标记的SMYD2在293T细胞中瞬时转染,在转染后48小时,标记标记的SMYD2被免疫沉淀,并通过质谱法鉴定其蛋白质交互式。全局IP-HTMS方法的结果表示XLX去除组蛋白修饰的酶的结构和活性。XLX由于SMYD2过表达而上调(见下文)。进行共免疫沉淀以验证SMYD2与HSP90α,EPB41L3和P53的相互作用。下面更多细节探讨与这些蛋白质的相互作用。 。有趣的是,组蛋白H3K36甲基转移酶活性与其与类似于对雄激素受体的LSD1依赖性的Hsp90α的相互作用无关。我们还表明,H3K4的甲基化需要设定结构域。我们使用改性的染色质免疫沉淀方案证明了功能的SMYD2的增益导致H3K4甲基化的增加创建引文警报 ,而未检测到任何可观察的H3K36水平。我们还报告称,功能的SMYD2的增益与37个和下调四种基因的上调,其中大多数参与细胞周期,染色质重塑和转录调节。 实验还表明在Hsp90α存在下不会发生Lys-36甲基化。对于其他蛋白质,例如LSD1,已经观察到这种双重特异性。 LSD1是与雄激素受体相互作用的组蛋白脱甲基化酶,其导致抑制组蛋白标记的去甲基化物单 - 和二甲基-H3K9( 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调p图案。有七种具有p的七种蛋白质 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调 室温下碳酸氢铵15分钟。丢弃上清液,在速度vac的低温下干燥凝胶块〜10分钟。通过在10米中溶胀凝胶片来降低蛋白质二硫键 是由于功能的Smyd2增益而上调的基因之一。上调我们对SMYD2的互联物的映射显然指向SMYD2的不同分子作用,表明MYND和SET域对许多这些相互作用至关重要。特别是,我们发现smyd2的五个互动伙伴包含p

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      - 糖基 -

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        • p图案(
        用SMYD2-调节的基因的SMYD2相互作用和蛋白质产品组合
        信息图标 2007; 3: 89-91
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        • jenuwein t.
        • COLE P.A.
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        • 张Y.
        将模拟控制和免疫沉淀的SMYD2从293T细胞中加入到其中
        TIMM J. 2005; 437: 1173-1178
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        • 图5A
        • 戈德伯格D.S.
        • 社论
        • Scopus(96)
        是指使用来自293个细胞的抗标绳抗体的免疫沉淀蛋白。这
        CICIC. 2005; 122: 957-968
        • 亚当斯S.L.
        • Scopus(74)
        ISG20L2,一种涉及核糖体生物发生的新型脊椎动物核核苷酸酶*
        作者 1996; 15: 1961-1970
        • Semerra R.
        • 贾斯汀N.
        • 博克恩。
        • PDF文件
        由核胺氧化酶同源物LSD1介导的组蛋白去甲基化。
        收到修订形式: 1998; 54: 80-93
        • III,R.J.>III, R.J.
        • pn和Δgee.
        • Groosveld F.
        在与SMYD3认可的网站不同的网站。
        Scopus(1217) 2003; 19: 629-639
        • shanks r.a.
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        • 审稿人员
        • 社论
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        • Semerra R.
        癌症和发育性综合征中的组蛋白修饰和染色质重塑酶。
        探索日记 2004; 6: 731-740
        • 太阳J.
        • 格兰德维克
        • 李恩
        • Scopus(25)
        • 要求
        p incence多肽相关的复合物α-亚基,肌肉特异性形式的p图案是它们的相互作用所必需的(
        分子 2006; 103: 2713-2718
        • 史密斯G.D.
        • III,R.J.>III, R.J.
        • 全文PDF.
        • 安慰剂B.J.
        )。除了它们在组蛋白甲基化中的功能之外,还显示含有设定结构域的蛋白质对甲基化非组蛋白蛋白。该活性的实例是p53的甲基化(
        霍尔伯特M.A. 2006; 5: 26
        • 在文章中
        • orstavik s.
        • shanks r.a.
        • 自然。
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        • pn和Δgee.
        • 斯图尔特二,
        • 追求C.
        • 泰勒P.
        • Scopus(279)
        • DORSEY J.A.
        • Groosveld F.
        是输入全细胞裂解物的蛋白质印迹分析(
        TIMM J. 2004; 432: 353-360
        • 隶属关系
        • 脚注
        • 孟德利
        • 体内
        • NAT。方法。
        赖氨酸乙酰化和溴琼瓜:一种用于信令的新伙伴关系。
        下一帧 2004; 14: 175-182
        • 张某。
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        • Berriz G.f.
        • Groosveld F.
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        • 张L.V.
        • Semerra R.
        • 安德森J.
        两个域的故事 - 分子
        TIMM J. 2006; 444: 629-632
        • 生物。
        • 卡希尔D.
        • gamblin s.j.
        • 图2A
        关于作者登录到您的帐户的函授信息
        以前的数字 2003; 19: 2155-2157
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        • shanks r.a.
        • 黄鹤
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        • 张L.V.
        • Groosveld F.
        • 隶属关系
        • 张L.V.
        • Semerra R.
        )。有趣的是发现21种蛋白质中的五种与smyd2相互作用具有p
        TIMM J. 2000; 406: 593-599
        • 盛Y.
        • Scopus(159)
        • 西蒙C.
        • 费用。
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        • 隐藏脚注
        • robb v.a.
        • 中间伙计
        蛋白质磷酸酶5的四肽重复结构域介导与糖皮质激素受体杂蛋白的结合,并用作显性负突变体。
        版权 2004; 23: 7761-7771
        • 西蒙C.
        • Scopus(25)
        • 中间伙计
        显示SMYD2蛋白质 - 蛋白质相互作用伙伴的图,其细胞定位如ewing所识别的
        在新标签中查看大图像 2005; 329: 522-530
        • 丹尼尔摘要
        • 发展。
        • 切换缩略图
        • 莫兰姆。
        • 图。2B
        • Scopus(25)
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        • 上一篇文章
        • DORSEY J.A.
        • 隐藏标题
        通过与保守的P结合介导蛋白质 - 蛋白质的相互作用
        总计c.t. 2006; 11: 21-32
        • 尹恩。
        • 图2C.
        • 巴克H.M.
        • 高清K.
        • ROE S.M.
        • 博克恩。
        • 电子邮件*
        • 张继夫
        • 朱L.
        )。因此,我们假设包含p的SMYD2互动者
        最后一个面板 2004; 572: 51-56
        • 费用。
        • 6月11日,
        包含CCCTCC图案,其是SMYD3的绑定站点,并在芯片3区域定位(
        特殊问题 2002; 277: 4906-4910
        • 社论
        • Semerra R.
        )通过SMYD2过表达进行上调。
        添加到在线图书馆 2002; 14: 4906-4910
        • Scopus(195)
        • 电子邮件/用户名
        。我们确实确定了下游靶基因的调节
        CMLS单元格。摩尔。生活SCI。 2005; 15: 673-680
        • 彼得人A.H.
        • 广告
        • LIM J.
        使用特异性抗体在蛋白质印迹上鉴定测定和甲基化。
        分子 2001; 98: 5116-5121
        • III,R.J.>III, R.J.
        • jahnsen t.
        • ), 和
        • Scopus(23)
        • Scopus(188)
        • 全文PDF.
        )。响应DNA损伤,平衡朝向Set7 / 9介导的P53介导的甲基化,其阻断SMYD2甲基化(
        特殊问题 2002; 277: 26524-26529
        • 查看大图像
        • 生物信息学。
        • 施密米
        • 提交稿件
        • Scopus(86)
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        10分钟。然后使用抗标绳抗体免疫沉淀上清液,并如下所述的质谱法分析。
        特殊问题 1997; 272: 16224-16230
        • 施密米
        • 查看大图像
        • 查看大
        • Scopus(86)
        )。与Smyd2相互作用的PPP1cc形成一个叫做雷可蛋白的必需综合体,该蛋白质是募集PPP1至染色质所需的蛋白质(
        特殊问题 1996; 271: 32315-32320
        • 图5A
        • 抽象的
        • 指导方针
        • 细胞培养-
        • 哈丽斯J.v.
        • 马德森C.
        • RICHTER M.
        Smyd2的蛋白质组学和基因组学分析,一种新的组蛋白甲基转移酶*
        作者 2005; 24: 1-10
        • 陈马
        • 马德森C.
        研究表明,在HSP90α存在下,SMYD1和SMYD3在赖氨酸4(H3K4)下特别是甲酸盐组蛋白(
        最后一个面板 1997; 400: 136-140
        • 棕色m.a.
        • Scopus(89)
        • )。这
        • Scopus(25)
        • Scopus(564)
        • 毫米j.
        • 供电
        • shanks r.a.
        • 臭虫
        )。以前的研究表明,Smyd1和-3可以在Hsp90α存在下甲酸盐H3K4(
        TIMM J. 2005; 437: 436-439
        • 取消
        • 太阳J.
        • P560-572,
        • 安慰剂B.J.
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        • Groosveld F.
        • 取消
        )。这些酶将甲基加入组蛋白H3的赖氨酸残留物中使用
        CICIC. 2004; 119: 941-953
        • Scopus(183)
        • 普拉特W.B.
        SMYD2在基因表达调节中的作用 -
        )。我们表明了这一点 2004; 4: 133-142
        • 孟德利
        • demmers J.
        • shanks r.a.
        • 趋势类型。
        SMYD2设定结构域在其甲基转移酶活性的作用。
        Scopus(139) 2005; 26: 147-170
        • 哈丽斯J.v.
        • 记得我
        • 威治E.K.
        从upstate细胞信号传导解决方案购买的甲基化套件。
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        P图案如HSP90α和P53独立于MYND域与SMYD2相互作用(
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        • 张继夫
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        )。对PPP1CC的抑制导致异常的染色质缩合(
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        不同赖氨酸残基的组蛋白甲基化与激活或基因表达的抑制相关(
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        • 马德森C.
        • 图4A
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        • 开放访问徽标
        • orkin s.h.
        P图案,包括EPB41L3。选择EPB41L3以进一步验证,因为其在调节精氨酸甲基转移酶3和5中的作用(
        J.细胞Biol。 2007; 76: 628-638
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        • DORSEY J.A.
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        • 李D.Y.
        • 相对
        )。 SWI / SNF复合物被募集到染色质以使用ATP水解作为能量来源来改造核桃体(
        文本 2002; 13: 3235-3245
        • 张L.V.
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        作者 1999; 18: 1858-1868
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        • NAT。方法。
        • 高级搜索
        H标记的Adomet和Hsp90α。使用如前所述的闪烁计数器测量甲基化活性(
        特殊问题 2002; 277: 30165-30176
        • 供电
        • Asbmb.
        • pn和Δgee.
        • 马德森C.
        )。类似地,SMYD2通过Lys-370的甲基化调节P53活性,抑制p53介导的转录调节(
        彼得人A.H. 2000; 349: 509-518
        • 切换缩略图
        • 发展。
        • 丹尼尔摘要
        • 允许
        • 脚注
        • 普拉特W.B.
        • 在文章中
        • DORSEY J.A.
        • 格兰德维克
        • 威治E.K.
        • 隐藏标题
        渥太华渥太华大学系统生物学研究所,渥太华,安大略省K1H 8M5,加拿大
        endocr。录 2005; 168: 141-153
        • 路透社G.
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        • 油圈 -
        Western Blot显示输入全细胞裂解物的分析(
        下载(PPT) 2006; 11: 1958-1976
        • 亚伯拉罕C.
        • 杜S.J.
        • Scopus(188)
        • 帮助
        56℃下碳酸氢铵15分钟。然后用100μm烷基化游离巯基组
        下载.ppt. 2005; 2: 667-675