Pinheiro e.m.

)。在单细胞阶段注射FYN和Y是吗啉(每次4 ng)。

  • 图表查看器
    Scopus(258)
    为了确定数据集中的错误发现率,我们对诱饵数据库进行了吉祥物搜索。吉祥物肽得分为40(

    如果您不记得密码,可以通过输入电子邮件地址并单击“重置密码”按钮重置它。然后,您将收到一封包含用于重置密码的安全链接的电子邮件
    人体表皮的层状体
  • NAT。 Biotechnol。
    斑马鱼甘皮甘草knypek在会聚延伸的燃烧运动过程中控制细胞极性。
    马修D.E.
    已收到:
    斑马鱼甘皮甘草knypek在会聚延伸的燃烧运动过程中控制细胞极性。
    Scopus(258)
    为了确定数据集中的错误发现率,我们对诱饵数据库进行了吉祥物搜索。吉祥物肽得分为40(
    人体表皮的层状体
  • 果蝇
    Scopus(258)
    如果您不记得密码,可以通过输入电子邮件地址并单击“重置密码”按钮重置它。然后,您将收到一封包含用于重置密码的安全链接的电子邮件
    人体表皮的层状体
  • 卷列表
    Scopus(258)
    如果您不记得密码,可以通过输入电子邮件地址并单击“重置密码”按钮重置它。然后,您将收到一封包含用于重置密码的安全链接的电子邮件
    人体表皮的层状体
  • 开放访问徽标
    Scopus(258)
    如果您不记得密码,可以通过输入电子邮件地址并单击“重置密码”按钮重置它。然后,您将收到一封包含用于重置密码的安全链接的电子邮件
    人体表皮的层状体
  • 被描绘在
    Scopus(258)
    如果您不记得密码,可以通过输入电子邮件地址并单击“重置密码”按钮重置它。然后,您将收到一封包含用于重置密码的安全链接的电子邮件
    人体表皮的层状体
  • J.质谱。
    显示脚注
    斑马鱼书。斑马鱼(Danio Rerio)的实验室使用指南。
    Scopus(258)
    为了确定数据集中的错误发现率,我们对诱饵数据库进行了吉祥物搜索。吉祥物肽得分为40(
    人体表皮的层状体
  • NAT。 Biotechnol。
    斑马鱼甘皮甘草knypek在会聚延伸的燃烧运动过程中控制细胞极性。
      2体内),证明Rho信号传导确实是Fyn的下游,燃料电池运动中的是。如果是,则,这些蛋白质的磷酸化状态的变化如何影响其活动仍有待确定。然而,引人注目,在FYN /是敲低时,在这些已知的CE电池运动的已知调节器中检测到磷酸化的差异。在Fyn / Yes敲低时改变了许多其他蛋白质的磷酸化。我们分析了我们的整个数据集,用于使用搜索工具通过用于检索相互作用基因/蛋白(串)(欧洲分子生物实验室)的搜索工具来预测激酶和激酶网络的预测。由于斑马鱼IPI数据库的注释差,这些尝试不会导致大量数据。这肯定会在未来几年内完善,并且我们公开存入的数据将有趣,看看我们在CE细胞运动中识别的磷酸蛋白和/或FYN / YES信令的功能是有趣的。.
      鉴定了两种同种型同种型血管生成抑制剂1-相关蛋白2样的磷酸肽(BIAP2L1A / BIAP2L1B),并在Fyn / Yes敲低时增强了两种肽的磷酸化(分别为1.35±0.10和1.36±0.11)(
      IGF2BP1是Vickz系列RNA结合蛋白的成员,并调节mRNA核导出,本地化,稳定性和翻译。 IGF2BP1与胰岛素样生长因子2 mRNA的5'-未翻译区域结合,从而调节其亚细胞定位和翻译。 Vickz蛋白在所有脊椎动物中高度保守,并在胚胎细胞中表达。建议Vickz蛋白通过定位RNA的能力在细胞迁移中发挥作用。许多人类肿瘤过度表达vickz蛋白(
      1IGF2BP1是Vickz系列RNA结合蛋白的成员,并调节mRNA核导出,本地化,稳定性和翻译。 IGF2BP1与胰岛素样生长因子2 mRNA的5'-未翻译区域结合,从而调节其亚细胞定位和翻译。 Vickz蛋白在所有脊椎动物中高度保守,并在胚胎细胞中表达。建议Vickz蛋白通过定位RNA的能力在细胞迁移中发挥作用。许多人类肿瘤过度表达vickz蛋白(
      生物分子质谱和蛋白质组学集团,博物馆研究和乌得勒支大学制药科学研究所,Sorbonnelaan 16,3584 Ca Utrecht,荷兰,Bijvoet
      • 去搜索
      泛素在细胞粘附,迁移和信号传导中的新功能。
      ,
      • Albert J.r. Heck.
      PTEN缺乏肠干细胞引发肠果白组能。
      )。此外,适当的CE运动等几个RHO和RAC的rho和RAR等调节器(如鸟嘌呤核苷酸交换因子)(
      • Albert J.r. Heck.
      斑马鱼中谜家族的特征。
      (将4%(v / v)在水中加入并涡旋2分钟,然后加入4μl新制备的氰基硼氢化钠(600米
      • 以前的数字
      • 纳吉F.
      • 纽约S.E.
      • 陶w.a.
      • 2021个问题
      • 参考
      • 范艾斯特L.
      • 纽约S.E.
      • 穆罕默德S.
      PDZ和肢体结构域 - 编码基因:分子相互作用及其在发育中的作用。
      ,
      • 卡西姆M.
      • 无障碍
      • 文章信息
      • 表二
      • 纳吉F.
      • 以前的数字
      氟化钾,然后注射20μl5%甲酸。在第二个h期间
      颗粒细胞碎片。将Lys-C(Roche诊断)加入裂解物中,并在37℃下进行4小时进行消化。用DTT的终浓度减少样品,终浓度为2米
      • 广告
      • 所有内容
      • 纽约S.E.
      • 克里安B.
      • 全文
      • 图5C.
      • 糖类研究
      • 以前的数字
      • Albert J.r. Heck.
      [因此,减少的Vimentin蛋白水平和磷酸化可能在CE细胞运动中具有作用。
      ,
      • 联系信息
      • 2021个问题
      • 春天
      • KATO Y..
      • 穆罕默德S.
      • 纳吉F.
      )。使用代谢标记曲线方法对于诸如大鼠等更高的生物来说是可行的(
      在FYN /是敲低(1.34和1.34±0.18)上增强了两种独特的磷酸肽,但不能排除蛋白质本身的上调,因为在样品中未鉴定对照肽(
      • MACEK B.
      • Scopus(7)
      • 正确的
      。所有注释的光谱都被上传到骄傲数据库。所有磷酸肽的光谱
      • MACEK B.
      • 5月22日,
      • 正确的
      在8:2(v / v)水/乙腈,pH 3.0中的0.05%甲酸中的NaCl。总数为25 scx分数(每个1分钟,
      • Plos一个。
      • 金S.W.
      哺乳动物Sly1调节内质网的棘突5功能到Golgi运输。2+ signaling pathway.
      温度敏感突变体的位置克隆揭示了斑马鱼翅片再生中细胞增殖期间SLY1的作用。
      • 发展。
      • COHN M.A.
      • Scopus(7)
      • 摩尔。细胞。蛋白质组学。.
      • 沃克C.
      • 咸肉N.H.
      • 下一篇文章
      • Scopus(29)
      ,来自PDLIM5的非磷酸化肽Liedtedwhprwhpr,显示在MS光谱和XIC中的接近1:1。
      ,
      • Scopus(464)
      • KATO Y..
      • Scopus(76)
      )。可以想到,Gravin介导FYN的一些效果,并在胃动脉间运动中介导一些影响。
      Scopus(255)
      • 黄S.Y.
      • 审稿人员
      • 道森J.
      • 打开完整表格
      • 权限
      • 糖类研究
      ¶现在地址:Centendemicina Regenerativa de Barcelona,Aiguader博士88,E-08003巴塞罗那,西班牙。
      );这可能是我们在本研究中使用的混合细胞群的结果,而不是先前研究中使用的均质细胞培养物。 Fyn / Yes敲低不会影响显影斑马鱼胚胎中的每种细胞类型,因此蛋白质磷酸化的差异将部分地通过不受FYN / BE敲低的影响的细胞的贡献来掩盖。
      • 尿素,50米
      • 下载.ppt.
      RAC活化剂Dock7通过局部磷酸化来调节神经元极性,通过静脉内磷酸化。
      WNT / Frizzled信号控制通过激活Antomyosin收缩性C.杆状杆菌胶带。
      我们鉴定的两种不同的磷酸肽与RAS-GTP酶活性蛋白质(间隙)SH3结构域结合蛋白2(IPI00500409和IPI004873772)匹配。其中一种蛋白质的磷酸化降低(0.79±0.02),而另一个磷酸化增加(1.30±0.03)(
      • 推特
      • 蛋白质组学。
      值≤0.005)包括他们的吉祥物得分
      • vos h.r.
      • Scopus(8)
      翻译后修饰的蛋白质组学分析。
      • alving k。
      • Boyd C.a.
      关于作者Monique Slijper的函授信息
      • 去搜索
      • 开放访问
      • 肛门。化学。
      • 信息图标
      • 下载.ppt.
      • 十字架F.R.
      • poss k.d.
      )肽。很明显,磷酸化肽中的MS光谱在FYN /是敲低(
      )。预测鉴定的磷酸肽通过CDK5(ScASSITE)变为磷酸化,有趣的是,看该位点的磷酸化是否导致帕苏过介导的信号传导中的功能变化在胃动脉间运动中。
      • COWBURN D.
      • 奥尔森J.V.
      • 要求
      • HSU J.L.
      • MACEK B.
      • amacher s.l.
      • 推特
      C. elegans和D. melanogaster的代谢标记为定量蛋白质组学。
      检测蛋白质表达和蛋白质磷酸化的显着变化。我们专注于Fyn / Yes敲低对磷酸化的变化,因为这些可能代表在CE细胞运动中具有作用的信号传导途径。磷酸化比的变化不如先前研究报告的那么高(
      • 登记
      • 推特
      应该解决对应的通信。电话:31-30-2121800;传真:31-30-2516464
      连胜,稳定的同位素还原胺化是一种快速可靠的替代全动物的代谢稳定同位素标记,并且可用于量化实验样品之间的蛋白质磷酸化的差异。此外,还原胺化方法可享受算法和比较任一两组蛋白质或蛋白质混合物之间的差异,并且它可以用作整个动物的硅酸和稳定同位素标记的廉价替代品( 1415好的
      • 搜索
      • 下载
      • 关闭信息
      • 尿素,25米
      • 十字架F.R.
      出版,MCP纸,2008年6月11日,DOI 10.1074 / MCP.M800081-MCP200
      • 约翰逊S.L.
      • 脚注
      • Den Hertog J.
      • BREKKEN D.
      • yisraeli J.K.
      • Scopus(117)
      • Scopus(57)
      • 图表查看器.
      • 下一个数字
      • 格林德利J.C.
      • Scopus(57)
      • 约翰逊T.
      在FYN /是敲低后,无蛋白质比例的单一磷酸肽和磷酸肽的定量 15条款和条件
      • 广告
      • 肛门。化学。
      • 安德森D.J.
      • poss k.d.
      • 十字架F.R.
      • 果蝇.
      从COPA磷酸肽NLPSPGAVDTEV中没有磷酸化的变化。
      Zebrafish胚胎中变质覆盖后磷酸化变化分析的实验方案。 摩尔。细胞。蛋白质组学。 最佳 查看大 )强度高于WT(
      • 文章题目
      • 汉堡P.C.
      • 肛门。化学。
      • 所有内容
      • 广告
      • 打开保存菜单
      • 基因(AMST。)。
      • poss k.d.
      施加到酵母信息素信号传导途径的定量磷蛋白酶。
      KATO Y. CDC42通过WNT / CA调节胶带期间的会聚延长运动
      • 作者
      • 米尔德T.H.
      • Scopus(29)
      • veenstra t.d.
      • 高级搜索
      )。鉴定了每个蛋白质的至少一种独特的肽,消除了数据集中的冗余。
      )。 AKT是磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)的直接下游效应器。值得注意的是,PI3K涉及CE细胞运动作为斑马鱼胚胎的治疗,PI3K抑制剂LY294002诱导CE细胞运动中的缺陷(
      )。这些研究揭示了巨大量的新磷酸蛋白和磷酸化位点以及这些磷蛋白质之间的关系。此外,磷蛋白酶的全局分析用于研究特定的信号传导途径(
      • 信息
      • 供电
      • 去搜索
      • 陈G.Y.
      ),显示MS频谱和XIC中的接近1:1的比率。
      • 供电
      • 版权
      • 这是C.
      • 图2A
      • 陈G.Y.
      在早期神经发展期间,细胞迁移需要RNA结合蛋白VG1 RBP。
      • 供电
      • 版权
      • 图2A
      • 信息
      • 图3C.
      • 陈G.Y.
      PDLIM5的磷酸肽SQPPSPNSISSPASNSAPKPSSGR在FYN /是敲低时增加(1.53±0.01;
      通过将Agilent 1100 HPLC系统(Agilent Technologies,Waldbronn,Germany)偶联到露天光谱仪(Thermo Electron,Bremen,Germany)来进行纳米射线LC-MS / MS。陷阱柱由三个单独的预柱:30毫米长×100-μm内直径Aqua C.
      细胞的协调运动对于普通脊椎动物腐化是必不可少的。在腐殖期期间,已经在收敛和延伸(CE)细胞运动中鉴定了几个重要的参与者和信号通路,包括非规范WNT信号传导。 FYN和是的,SRC系列的核心酶的成员,也是CE运动的主要监管机构。在这里,我们通过使用野生型斑马鱼胚胎的磷酸磷蛋白酶与抗fyn /是敲低胚胎的磷酸磷蛋白酶进行了调查的信号通路,该敲击胚胎显示特定的Ce细胞运动缺陷。用于定量,我们使用肽的还原胺化使用差异稳定的同位素标记。将来自野生型和FYN / YES敲低胚胎的等量的标记肽混合并通过在线逆转期TiO分析

      见文章

       重用已发布的材料的许可

      如前所述包装成GELOADER尖端的提取盘(
      • 打开保存菜单
      全球性,体内和现场特异性磷酸化动力学中的信令网络。
      版权所有©2021美国生物化学和分子生物学协会。由elsevier公司发布代表美国生物化学和分子生物学协会。版权所有。
      • 尿素,50米
      • 下载.ppt.
      RAC活化剂Dock7通过局部磷酸化来调节神经元极性,通过静脉内磷酸化。
      手动收集50-μL洗脱体积并在真空离心机中干燥。

       以前的缩略图

      )。虽然这些结果可能是有趣的,但我们专注于Fyn敲低的蛋白质磷酸化的变化,因为这些最有可能反映信号传导潜在的CE细胞运动的差异。
      • 第四届。
      • 文章题目
      • 以前的数字
      斑马鱼胚胎和微注射 -
      )。随后4μL甲醛-H m urea, 25 mm 基于所有磷酸肽的价值。m 磷酸钠,5米m 在新选项卡中打开表m 质谱仪以数据相关模式操作,自动在MS,MS / MS和中性丢失驱动MS之间切换 g )。因此,adducin可能在CE细胞运动中具有作用。新鉴定的网站的磷酸化还具有在该过程中的作用仍有待确定。m 非规范性WNT信号由Kaiso转录压缩机和P120-连环蛋白调节。m 在sciencedirect上访问本文 m urea, 50 mm Has2是在RAC1上游需要的,以治理斑马鱼胶带期间侧面细胞的背部迁移。

       关于作者Chopling的函授信息

      提供对注释光谱的访问 十字架。所有鉴定的磷酸肽的列表(吉祥物评分≥40m早期斑马鱼胚胎的蛋白质组学。2 ≤0.005),假发现率估计为0.41%。所有原始数据和注释光谱都被提交到骄傲数据库。 m在我们的屏幕中也鉴定了对应于β-catenin的磷酸肽TPSMGGTQQQFVEGVR。 β-catenin的蛋白质比在fyn /是敲低时没有显着变化(0.96±0.03),而鉴定的磷酸肽显示出降低(0.73±0.13)(2 )。在斑马鱼中,胚胎敲低在乳化结束后不久的胚胎致死性,胚胎显示伸长缺陷和紊乱的躯体,这表明胚胎发育期间细胞骨架和一人组织在细胞骨架和一人组织中的作用(

       补充材料

      - 乙酰化,氧化甲硫氨酸,丝氨酸或苏氨酸的磷酸化,“重”肽氨基末端和赖氨酸残留物的“重”甲基化设置为可变改性。胰蛋白酶被指定为蛋白水解酶,允许允许两种错过的裂解。将前体离子的质量耐受设定为5ppm,将片段离子的离子设置为0.9Da。 18 n-代谢标记。18 )来自COPA,CPLSGACYCPK的对照,非磷酸化肽(
      • 黄克。
      • Scopus(90)
      • 文本
      • 密码
      • 格林德利J.C.
      。在24 hpf,30 wt和30 fyn /是敲低胚胎手动剥离,脱胶,合并和裂解。用胰蛋白酶消化蛋白质混合物,随后用正常甲醛标记(CH
      )。它还与小GTP酶Rab(酵母中的YPT1p)相互作用,是真核细胞中蛋白质转运的关键调节剂。 SLY1参与囊泡运动和对接以及膜重塑和融合。在斑马鱼中,显示了鳍片再生中细胞增殖所必需的SLY1(−1 solvent B (500 mm 分析大鼠大脑中BKCA通道α亚基的磷酸盐状态揭示了意想不到的模式和复杂性 DOI: )。例如,非磷酸化的对照肽CPLSgacyCPK显示在

       生物学习。 Biophys。 res。安排。

      )。显示出磷酸化变化的大量小GTP酶调节剂表明,在FYN /是敲低时rho和RAC活动的平衡变化。这与先前的工作一致,证明CE细胞运动受到小GTP酶(18 COPA的NLPSPGAVDTEVR的光谱。磷肽(2 )。 SLY1是酵母中SLY1P的脊椎动物同源物。已知从内质网的囊泡输送到GOLGI(18可以确定价值,并接受吉祥物评分≥80(列入 m HAACK-SORENSEN M. m 免费注册用户名和密码18 在新标签中查看大图像2在Fyn / Yes敲低时磷酸化较少的肽中,我们鉴定了SLY1的单一磷酸肽(抑制率YPT)(FY / WT比,0.65;2 淡化胰蛋白胨脱盐,干燥
      • 开放访问
      • 肛门。化学。
      • Embo Rep。
      • 信息图标
      • 陶w.a.
      • poss k.d.
      仅用非磷酸化肽计算。2)。在Fyn / Yes敲低时腐蚀性的CE细胞运动缺陷被活跃的RhOA救出(
      标准PDF(在新标签中打开)2 )来自Coodomer蛋白质复合亚基α(COPA)对Fyn / Yes敲低的显着变化没有显示出显着的变化(1.04±0.06)( m 材料(3M empore C. m Prickle 1在斑马鱼的腐蚀性和神经元迁移过程中调节细胞运动。m )。这可能是因为TiO的磷酸肽高富集m 材料和方法m 陷阱专栏。随后的H.m )。 24 HPF的WT和FYN / YES敲低胚胎的代表图片2)。此外,Fyn / Yes敲低导致蛋白质酪氨酸激酶活性曲线的特定变化,所述蛋白质酪氨酸激酶活性谱还通过共注入Fyn来拯救,并且是RNA( m 材料(3M empore C. m (使用水中4%(v / v))。基于通过在常规LC-MS运行和总体肽信号强度比较的总肽信号强度下通过在常规LC-MS的等分试样测定的总肽量和比较总肽信号强度而确定的总肽量,将光4H和重的4d-二甲基标记的样品混合在1:1的比例中。

       信号通路。

      XvickZ3是迁移形成神经管的屋顶板的细胞和神经嵴细胞迁移的细胞(3 在新选项卡中查看高分辨率图像 m/z 值≤0.005)。阈值的理由如前所述( m/z )。尚未报道腺苷酸的鉴定的氮磷酸化位点,上游激酶未知。 adducin是一种与肌动蛋白结合的膜骨架蛋白。以前已经表明,通过蛋白激酶C和Rho激酶的adducin的磷酸化涉及细胞运动,扩散和迁移(3 precolumn以此流速和绑定( m/z 在斑马鱼中的腐蚀性 - 所有关于粘合性?

       使用饼干

      和女士2 最佳 MS3 在100分钟的梯度溶液(80%溶剂B(80%乙腈,0.13 FYN和是的是SRC系列酪氨酸激酶的成员。然而,我们没有检测到下游靶标的酪氨酸磷酸化的变化。这主要是因为通常是酪氨酸磷酸化的低丰度,并且在该内源样品中使用的混合细胞群。我们之前使用过免疫亲亲亲亲亲亲亲亲亲亲亲爱的方法,抗TYR(P)抗体,酪氨酸磷酸化在早期斑马鱼胚胎中可检测到( N)。有趣地是由FYN / YEN敲低调节的磷蛋白蛋白的子集是已知的胃灭菌细胞运动(KAISO,PDLIM5和GRAVIN),肌动蛋白细胞骨架重组(Adducin和BIAP2L1A / B)和WNT信号通路(β-连环蛋白, SOX-3和Kaiso)或涉及小GTP酶信号传导(SLY1,RAS-GAP SH3BP2和DOCK7)(
      )。这两种Ras-Gap Sh3结合蛋白2蛋白的序列对准表明它们共享63%的同一性,并且磷酸肽显然是明显的。 Ras-隙增强了结合的GTP到GDP的水解,导致Ras的失活,这两个RAS-GAP SH3结构域结合蛋白调节RAS - 间隙活性。然而,在该方法中(de)磷酸化这些蛋白质的作用仍然确定,并且发现这些蛋白质之一的磷酸化是上调的,并且对另一个磷酸化响应于FYN / YEL敲低而下调有趣的。2 脱甲酸钠,pH8.2和EDTA的无蛋白酶抑制剂混合物(Sigma)。将均化裂解物以14,000×离心 t FYN /是敲低的磷酸化没有变化 - p 定量所有肽的中位数。学生 p 准确定量蛋白质表达和特异性磷酸化。 跳到主要内容原料质谱数据已经沉积在蛋白质组学识别,骄傲,数据库中(
      通过氨基酸在细胞培养中稳定同位素标记,用于定量蛋白质组学。p 通过极化胚胎电池运动塑造脊椎动物计划。
      • 去搜索
      • 开放访问
      • 肛门。化学。
      • 信息图标
      • 下载.ppt.
      • 十字架F.R.
      • poss k.d.
      )肽。很明显,磷酸化肽中的MS光谱在FYN /是敲低(
      从PDLIM5的SQPPSPNSISSPASNSAPKPSSGR的磷酸化在FYN /是敲低的PDLIM5上调。
      )。响应于FYN / YEN敲低(1.13±0.03和1.11±0.16,这些蛋白质的对照肽略微增加(1.13±0.03和1.11±0.16;p 值≤0.005)并手动检查。在手动验证MS光谱和归一化后,验证了348个磷蛋白。

      英语

       创造性的公共归因(CC到4.0)

      使用Zorbax Bioscx-Series II柱进行强阳离子交换(0.8毫米内径×50毫米长;粒度,3.5μm),A Famos AutoSampler(LC Packings,Amsterdam,荷兰),Shimadzu LC-9A二进制泵,以及SPD-6A紫外线探测器(日本Shimadzu,日本)。在强阳离子交换(SCX)色谱之前,使用小的C塞进行混合和标记的消化物2提供价值。一些磷酸肽仅被鉴定和量化一次,而相应的蛋白质比基于多种非磷酸化肽( Fig. 1.
      图缩略图GR4.
      Fig. 1,上图)。基于磷酸肽的鉴定和定量一些蛋白质,没有关于相对蛋白质水平的信息(A关于作者Joost Gouw的函授信息看法其他ASBMB出版物图像关闭图形观众 B)。然而,为了检测磷酸膜的动态变化,定量分析是必不可少的。定量方法改变并且基于二维凝胶电泳(DIGE),化学方法(ICAT和相对定量(ITRAQ)的同位素标签)或细胞培养中氨基酸的稳定同位素标记(硅酸)(2关于作者Simone Lemeer的函授信息2 rho鸟嘌呤核苷酸交换因子XNET1涉及在外爪蟾发育过程中的腐蚀性运动。 MO格林德利J.C.
      这项工作得到了荷兰科学研究组织(NWO Grant 0151.131),欧洲联盟研究培训网络HPRN-CT-2000-00085和荷兰蛋白质组学中心的支持得到支持。本文的出版费用部分按付款方式部分支付。因此,本文必须根据18 U.S.c,标明“广告”。第1734节仅表明这一事实。
      • 尿素,50米
      • 下载.ppt.
      RAC活化剂Dock7通过局部磷酸化来调节神经元极性,通过静脉内磷酸化。
      )包括之前未报道的磷酸化部位。 SLY1蛋白水平不受FYN / YEN敲低的影响(蛋白质比,1.13±0.20;
      • 去搜索
      • 尿素,50米
      • 图5B.
      • 鉴别
      • 十字架F.R.
      • poss k.d.
      • 下载.ppt.
      )。磷酸化肽中的MS谱/是敲低(
      Silberblick / Wnt11在斑马鱼腐蚀过程中介导收敛延长运动。 体内)。 Dock7是RAC激活器,是轴突形成的关键稳压器。 Dock7和RAC活化导致磷酸化和随后的Stathmin / OP18灭活,一种稳定的蛋白质(2磷蛋白质:蜂窝信号传导的新见解。2)。伯胺使用光甲醛或重(含氘)甲醛同位素标记。因为胰蛋白酶通常用作消化的酶,所以大多数肽将含有至少一个标记,因为每个氨基末端和每个赖氨酸都标记。
      • 下载Hi-Res
      • 被描绘在.
      • Scopus(66)
      • 史密斯J.C.
      • 道森J.
      • 细胞。
      • 全文
      • Scopus(201)
      • 帮助
      ,并重悬于100μl三乙基碳酸氢铵(100μl
      鉴定了1400多种蛋白质,量化和手动检查(2向Jeroen Den Hertog发送电子邮件
      • 去搜索
      • 开放访问
      • 肛门。化学。
      • 信息图标
      • 下载.ppt.
      • 十字架F.R.
      • poss k.d.
      )肽。很明显,磷酸化肽中的MS光谱在FYN /是敲低(
      ,
      • 开放访问
      • 肛门。化学。
      • Embo Rep。
      • 信息图标
      • 陶w.a.
      • poss k.d.
      仅用非磷酸化肽计算。2)。在Fyn / Yes敲低时腐蚀性的CE细胞运动缺陷被活跃的RhOA救出(
      ,消化了WT和FYN / YEN敲低的裂解物,首先用光(WT)和重(FY)甲醛标记所得肽混合物。将样品混合在1:1的比例中,并通过强阳离子交换色谱分离混合物。通过自动在线RP-TiO进一步分析所获得的SCX级分中的每一个
      蛋白质 - 酪氨酸激酶活性分析爆震斑马鱼胚胎。跳到主要内容,侧视图为1天的后期野生型(2 进行测试以检测重大调节( t 加入碳酸氢铵和胰蛋白酶(Roche诊断)。在37℃下进行消化过夜。p )。特别是Silac已被证明在诱导信号转导途径时研究磷酸膜的变化。该标签方法具有以下优点:在将标记单元格混合在一起之后并且同时执行所有其他样品处理。然而,使用Silac仅限于单细胞培养物。其他方法使用稳定的同位素代谢标记,其中所有氨基酸和肽通过含有专门的培养基上的生长细胞标记
      • OTT E.B.
      • 汉堡P.C.
      )。一起占据,IGF2BP1可能在斑马鱼发育过程中具有细胞迁移的作用。
      ,
      • OTT E.B.
      • Scopus(312)
      • 果蝇.
      • 陈S.H.
      • 隐藏脚注
      • 汉堡P.C.
      WNT / Frizzled信号传导的RAC和RHO的共同是脊椎动物腐蚀性所必需的。
      )。非规范WNT信号传导的作用,以激活包括小GTP酶,RHO,RAC和CDC42的几个下游效应器。反过来,Rho激酶通过调节肌动蛋白 - 肌球蛋白收缩和介导细胞骨骼动力学(
      )。 Dock7已被提出是不仅针对RAC的鸟嘌呤核苷酸交换因子,还用于RHEB,将GDP结合的RHEB转化为GTP绑定状态,尽管没有直接证据( p 胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1的QMPSPGsgipsk的磷酸化在FYN /是敲低的下调。 lee z. ≤0.05)。在上调的蛋白质中,发现vitherogins在Fyn / Yes敲低的中占据上调。这种上调vitelloginin是手动脱泡手术的伪影,因此我们从进一步分析中省略Vitellogins。骨骼肌霉菌和肌肉肌动蛋白被证明在FYN /是敲低的情况下显着下调。已知actomyosin收缩性参与散热细胞运动,由Wnt信号传导控制( lee z. FYN /是和非规范的WNT信号传导在脊椎动物胶带电池运动中的RHOA上融合。 p Gravin调节斑马鱼胶带期间轴伸长所需的中胚层细胞行为变化。 p 然而,我们检测到磷酸肽的显着变化。 348磷蛋白的141的磷酸化由Fyn / Yes敲低(72升和69)改变(表I.)。非规范Wnt途径在Ce运动中具有核心作用,Wnt11和Wnt5中的突变导致CE细胞运动缺陷(表I.值得注意的是,大多数磷酸肽和蛋白质水平没有改变Fyn / Yes敲低。显示348磷蛋白(62%)中的207个磷酸化比分布在0.8和1.2之间( 图缩略图GR5.,MS光谱和XIC显示磷酸肽的增加。 p )。量化的蛋白质被标准化为符合日志 显示更多工具菜单Actomyosin收缩性和微管在外爪孔瓶细胞中驱动顶端收缩。 OTT E.B. 最佳 编辑委员会 )和非磷酸化(.
      lee z.显示MS频谱和磷酸化的XIC(
      PDLIM5的SQPPSPNSISSPASNSAPKPSSGR频谱。
      表I.进行测试以检测重大调节。显示555个蛋白质被显着调节(
      * p 搜索本作者的文章
      X 有针对性的蛋白质组学 p 大多数蛋白质的磷酸化在FYN /是敲低时没有显着变化(
      PDLIM5的SQPPSPNSISSPASNSAPKPSSGR频谱。
      ©2008 ASBMB。目前由elsevier公司发布;最初由美国生物化学协会发表的生物化学和分子生物学。
      • 孟德利
      • Doanload .ppt.ppt.
      • Scopus(124)
      • 隐藏标题
      亲和力在100分钟的梯度〜40%溶剂B(80%乙腈,0.1
      • 被描绘在
      • 奥尔森J.V.
      • 打开数字菜单
      • 克拉默C.
      • 推特
      )。 COPA的对照肽的肽比也不变(1.21±0.05)(
      • 查看大
      • COWBURN D.
      • 肛门。化学。
      • amacher s.l.
      • 当前的卷
      • 推特
      • 蛋白质组学。
      斑马鱼的比较磷蛋白蛋白质/是吗酚敲低胚胎
      )。最近显示斑马鱼胶带期间涉及轴伸长素。它被认为用作促进细胞变化的支架蛋白质。在吗啉介导的瓜替林的敲尾时,细胞通常迁移到胚胎的背侧,但不能沿前后轴线适当地延伸(

       磷酸化增加 -

      柱子。由于在质谱仪中,由于在质谱仪中未采样,未在未结合的级分中未检测出这些蛋白质的非磷酸化肽。因此,基于其磷酸肽仅量化低丰度磷蛋白。2 Scopus(44) 接触)。在后一种情况下,我们不能排除蛋白质或下调,但磷酸肽的绝对量变为变化。所有磷蛋白清单和FYN / YES敲低和WT中的磷酸化比率可用作lee z.,来自IGF2BP1的非磷酸化肽Mileimnqeak显示在MS光谱和XIC中的接近1:1的比例。撒托T.不/ Fig. 2 关于作者Jeroen Den Hertog的函授信息10.1074 / MCP.M800081-MCP200撒托T.磷酸肽的标准化比例显示在FYN / YEL敲低左右的分布。, 小姐差分磷酸化分析 - 吴H.图形查看器(在新标签中打开)价值。类似地,蛋白质水平,肽数和各个标准偏差的平均比例和撒托T.我们使用cookie来帮助提供和增强我们的服务和定制内容和广告。继续你同意
      图缩略图GR1.
      Fig. 2我们鉴定的磷蛋白的磷酸化比的差异不如其他最近研究报告的那么高(A剩下2 中立损失49±0.5后的事件 B用于定量蛋白质组学的稳定同位素二甲基标记。 C发育限制肌动蛋白 - 调节分子控制斑马鱼腹腹部的形态发生细胞运动。
      显示了鉴定的差异磷酸化的磷酸化合物,其被高置信度鉴定。我们还确定了来自对应于磷酸肽的蛋白质的对照,非磷酸化肽的比例。这使我们可以确定相对蛋白质表达水平和磷酸化水平,从而区分蛋白质水平和磷酸化状态的变化。多次测定磷酸化的比例,并且给出了平均值
      • 科学。
      • 普拉斯克R.H.
      在线在体内斑马鱼磷蛋白蛋白质自动化:从大规模分析到一个胚胎。
      不/ KATO Y. 用稳定同位素标记用细胞培养氨基酸稳定同位素标记的ephb2信号传导的定量磷酸蛋白酶体。
      • 科学。
      • 新浪微博
      • Scopus(70)
      • 普拉斯克R.H.
      )。所有这些信令途径如何在CE电池运动中配合仍有待确定。
      甲酸)。通过注射30μl100米来实现磷酸化肽的洗脱
      甲酸)。通过远端涂层发射器提示喷涂洗脱液(新物镜)对接到分析柱。在高压供应,壁图和电喷雾针之间,放置另外的33兆瓦电阻以减少离子电流。lee z.Fyn / Yes敲低后下调和上调的磷酸肽
      • KATO Y..
      • 取消
      • ;另见女士
      • 自然。
      • 吴C.C.
      • 抽象的
      • 权限
      • 见文章
      • 查看大
      • 在文章中
      • 前帧
      • Scopus(235)
      • 数字
      • 李X.
      • 电子邮件
      Hela细胞核磷蛋白的大规模表征。
      在Fyn / Yes敲低时磷酸化减少的肽中,我们将磷酸肽QMPSPGsgipsk(其中PS是磷源来自胰岛素样生长因子2 mRNA-结合蛋白1(IGF2BP1)具有高置信度(MS
      • 田Q.
      • 韩杰克。
      • 去搜索
      • 广告
      • Albert J.r. Heck.
      • Scopus(51)
      )。从我们的数据来看,显而易见的是,这种小GTP酶调节剂的磷酸化受FYN / YES敲低的影响。
      不/
      )。磷酸肽在Fyn / Yes敲低(0.52±0.10)中较少。为了监测IGF2BP1蛋白表达,我们量化了对照非磷酸化肽的比例,发现蛋白质比为0.93±0.19(lee z.网址:网站:McPro-site; ctype:string:resident;问题:问题:pii \:s1535947620x60427;文章:pii \:pagegroup:string:strick;文章查看; wgroup:string:string:迁移的网站;页面:字符串:显示全文;杂志:Journal:McPro; RequestedJournal:Journal:Journal:McPro;产品:产品:产品:产品:产品\:HA
      • Scopus(30)
      • 图像
      • 公园J.I.
      重新分配或重新发布最终文章
      )。基于对照的非磷酸化肽的蛋白质比也显示出与WT相比的略微上调,尽管比磷酸肽更低(1.22±0.17;
      Hubrecht Institute-Royal Netherlands艺术与科学学院和大学医疗中心Utrecht,Uppsalaan 8,3584 CT Utrecht,荷兰lee z.Kaiso磷酸肽SQIQPDSPNTASLPSPK的磷酸化在FYN /是敲低时降低(FY / WT比,0.76±0.08),但我们没有检测Kaiso的非磷酸化对照肽(
      • alving k。
      • 发展。
      • 图。2B
      • 图表查看器.
      TSC1-TSC2复合物的磷酸化和结合配偶分析。
      保守家族RNA结合蛋白在胚胎发育和致癌中的参与。
      。来自COPA的磷酸化和非磷酸化的肽均涉及细胞周期控制,不受FYN的敲低而受到影响。 表I.O / ACN梯度洗脱并以〜100nl / min的流速使用分析柱分离结合的肽。磷酸化肽将通过TiO 表I.使用BioWorks 3.3将光谱转换为单.dta文件。内部开发的Perl脚本用于将原始和准确的父质量分配给所有MS
      • 社论
      • 公园J.I.
      PPT / WNT5在斑马鱼腐生过程中调节细胞形状和运动的作用。
      蛋白质组学是研究信号传导途径和相关的翻译后修饰的强大方法,其传播信号,例如蛋白质磷酸化。磷蛋白质的最新进展使得全局表征完全生物的可行性(
      • 舍甫琴科A.
      • 开发。达恩。
      • Scopus(532)
      • amacher s.l.
      腐蚀性运动,淘汰的Kaiso导致非规范Wnt11的表达增加,CE细胞运动的调节剂(
      值和蛋白质比不能确定;比率基于一个(磷酸)肽。
      我们检测到的所有磷酸肽通过MSQUANT和手动验证。随后基于它们的比率和吉祥物得分(≥40和≥40)过滤磷肽和磷蛋白。表I.定量所有肽的中位数。内部开发的计划用于确定标准偏差,以及学生 KATO Y. )。该方法广泛用于诸如酵母等较低生物,但也显示出有效标记更高的生物,如
      • 张G.
      • Plos一个。
      • 2021个问题
      • 供电
      • 电子邮件
      • J. Cell SCI。
      • 记得我
      • 春天
      基于磷酸磷蛋白酶学研究内源性磷酸化酶在果蝇的果冻蛋白酶中。
      鉴定了韦林/ aKAP12的两种磷酸肽。磷酸肽之一增加(1.75),而另一个磷肽保持不变(1.05)。蛋白质水平在FYN /是敲低时增加(1.29±0.29)(

       编辑和编辑委员会

      )。实际上在FYN / YEN敲低和WT裂解物中检测到等量的非磷酸化肽MILEIMNQeak( lee z.克里斯·朱飞2 Scopus(44) 结果)。 PDZ / Lim蛋白在各种细胞过程中具有重要作用。 PDLIM5属于含有一个PDZ和三个雷米域的PDZ / LIM蛋白的enigma亚家族( lee z.拟南芥早期Elicitor信号传导的定量磷蛋白酶。, 小姐adducin:结构,功能和调节。吴H.)。随后胚胎在8中裂开表I.环加氧基酶-1衍生的PGE2通过G蛋白偶联EP4受体促进细胞活性在脊椎动物胶凝中。他x.c。-rp-lc-ms / ms。在“材料和方法”下详细描述了实验程序,并描绘了完整实验方法的示意图概述
      • 上一篇文章
      • 无障碍
      )。研究磷酸化在SLY1功能中的作用将是有趣的。
      在脊椎动物胶带的形态发生细胞重新排列坐标三种胚层的运动,最终产生显影胚的基本体系。腐蚀过程中的主要细胞运动之一是收敛和延伸(CE)。
      • 密码
      • 坎特利L.C.
      • 发展。
      • 无障碍
      请在提交搜索之前输入一个术语。
      不/
      补充表3.
      Fig. 3在56°C;随后以4米的终浓度用碘乙酰胺烷基化样品A剩下2 本文的在线版本(可提供 B)。鉴定的网站是报告的AKT磷酸化部位( CWnt / Frizzled激活Rho调节脊椎动物腐蚀性,需要一种新型甲状腺同源蛋白DAAM1。
      )。然而,这些方法并不简单,并且很昂贵。相反,相对简单的化学标记方法最近可用,原则上允许定量任何感兴趣的生物学样本。表I.累积到目标值500,000后400。选择在5000℃的阈值下的三个最强烈的离子在线性离子阱中的碰撞诱导的碎片,其在积聚到目标值10,000的目标值后35%的常规碰撞能量。选择数据相关的中性损耗设置以触发MS
      • Scopus(49)
      • 沃尔斯顿T.
      • Scopus(44)
      使用LTQ-orbitrap质谱仪。通过MSQUANT定量鉴定的肽并手动验证。
      使用半胱氨酸亲和标签组合的细菌和哺乳动物蛋白质的定量分析和
      o),重,用于敲低胚胎。将样品在1:1的比例(总肽含量)中混合。首先将所得肽混合物分离并通过SCX色谱分离,在酸性条件下,使磷酸肽比普通胰蛋白肽更早洗脱(lee z.)。向前和逆向遗传筛网已经深入了解在腐蚀过程中驱动CE电池运动的许多信号通路( lee z. - 重放阶段LC-MS / MS。定量磷酸化和非磷酸化肽,检测蛋白质表达和/或磷酸化的显着变化。我们确定了348个磷蛋白,其中69磷蛋白蛋白在Fyn / Yes敲低胚胎中磷酸化降低,72显示出磷酸化增加。在这些磷蛋白质中是已知的细胞运动调节剂,包括adducin和pdlim5。我们的研究结果表明,与晶圆脉介导的敲低相结合的定量磷蛋白酶可用于识别在斑马鱼发育中起作用的新型信号通路
      二甲基标记为标签样品提供了相对简单,便宜,简单的策略。在稳定的同位素中,肽的伯胺基(赖氨酸和氨基末端)用甲醛通过还原胺化标记(表I.)已被确定。 Morpholino介导的FYN双击倒也导致CE电池运动受损。这些击倒是具体的,因为它们被FYN的共同表达救助,是的。 FYN /是在斑马鱼中降低WNT11和WNT5中的异组突变。这些表型通过活性RHOA振荡,表明WNT11和FYN /是在信号通路中下游的RHOA(
      • Scopus(110)
      • alving k。
      • 广告
      )。在对照中,不磷酸化肽,强度相似;这也反映在XIC中(
      不/
      在CE运动期间,细胞朝向胚胎的中线收敛并沿前后轴延伸,这是需要精确调节细胞极性,细胞迁移和细胞划分的过程(表I.)。 Vimentin在物种之间显示出高度的序列同源性,并且具有高度磷酸化。 Vimentin的磷酸化与其在细胞粘附,迁移和信号中的功能有关(
      • 差异化。
      • Plos一个。
      • 新浪微博
      • 奥尔森J.V.
      • Scopus(490)
      具有稳定同位素的哺乳动物的代谢标记,用于定量蛋白质组学分析。
      ,
      • 安德森D.J.
      • Scopus(490)
      通过将它们喂养重标记酵母(
      )。反义大肠杆菌是从Genetools(Philomath,或)的命令。对吗啉靶向近于相应CDNA的开始ATG的靶向,并且之前已经描述了它们的序列(
      • 开发。 BIOL。
      • Scopus(155)
      • 翻译文章
      • Scopus(99)
      • Scopus(90)
      保持斑马鱼,并如前所述进行胚胎上演(
      如果地址与有效的帐户匹配,则会将电子邮件发送到__email__,其中包含重置密码的说明

       在最强烈的片段离子中检测到单位。

      胚胎,30种野生型(约100μg)和30 fyn /是敲低(约100μg)(24小时后受精(HPF)),手动剥离并用没有钙(Fig. 4获得。全扫描MS谱(来自2 关闭登录弹出窗口 图。1A)。在其中一种非磷酸化的肽中,Liedtedwhpp,强度相似,这在XIC中反映出来(lee z. 最佳 何S.H.来自磷酸肽的单个MS / MS光谱被接受吉祥物评分≥40(lee z.-AQ分析列。肽在100%溶剂A中以5μL/ min捕获(0.1 文章Vimentin蛋白表达和磷酸化两者都显示在Fyn / Yes敲低时下调(分别为0.56±0.04和0.68±0.06)(
      )斑马鱼胚胎。
      Fig. 4在20°C时。洗脱液稀释至2 The log2 以及用于确定比率,标准偏差和的肽数量,标准偏差
      图缩略图GR3.
      Fig. 5在壁图中获得了300至1500),分辨率为60,000A剩下2 关于作者Albert J.R. Heck的函授信息B脊椎动物胶凝过程中的细胞运动模式。C普雷柱,后跟5毫米长×100-μm - 内径TiO

      联系我们

      NAT细胞BIOL。 ),证明Rho信号传导确实是Fyn的下游,燃料电池运动中的是。如果是,则,这些蛋白质的磷酸化状态的变化如何影响其活动仍有待确定。然而,引人注目,在FYN /是敲低时,在这些已知的CE电池运动的已知调节器中检测到磷酸化的差异。在Fyn / Yes敲低时改变了许多其他蛋白质的磷酸化。我们分析了我们的整个数据集,用于使用搜索工具通过用于检索相互作用基因/蛋白(串)(欧洲分子生物实验室)的搜索工具来预测激酶和激酶网络的预测。由于斑马鱼IPI数据库的注释差,这些尝试不会导致大量数据。这肯定会在未来几年内完善,并且我们公开存入的数据将有趣,看看我们在CE细胞运动中识别的磷酸蛋白和/或FYN / YES信令的功能是有趣的。 碳酸氢铵,pH9.0(用氨调节)含有10米的氨基2)。将所得混合物在室温下涡旋60分钟。加入16μL氢氧化铵(水中1%)以消耗过量的甲醛,加入5%甲酸(水中)以酸化溶液。用于氘甲基化标记,甲醛-D DOI: 间充质干细胞分化中发散生长因子效应的机制。Fig. 4)。只能鉴定磷酸肽,因此不能排除蛋白质本身的上调。 BIAP2L1A中的磷胶是GSK-3的潜在基质,如Scarsite所预测的。 BIAP2L1A / B蛋白含有一种进化保守的胰岛素受体酪氨酸激酶基酶P53同源域(IRSP53 / MIM),已知致肌蛋白细丝并与小GTPase RAC相互作用(表I.)。随后对此产生的SCX级分进行我们的在线RP-TiO2 表现出显着降低磷酸化的磷酸肽是QEVVP(TT)PPPPPSVGK(其中Pt是磷酸萘醌)来自adducin 3(0.76±0.09)。蛋白质比在FYN /是敲低时保持不变(1.01±0.04)(
      )。然而,这些实验所需的材料(每个样品〜2000胚胎)需要大规模扩大的吗啉注射或进一步改进技术,以允许在FYN /是敲击中检测含磷酸含磷酸氨氨酸的蛋白质胚胎。这里描述的工作的目的不是为了检测Fyn的直接基板,而是识别在CE细胞运动中具有作用的信号传导途径的组件。
      • 供电
      • 版权
      • 这是C.
      • 图2A
      • 陈G.Y.
      在早期神经发展期间,细胞迁移需要RNA结合蛋白VG1 RBP。
      ,
      • 供电
      • 版权
      • 图2A
      • 信息
      • 图3C.
      • 陈G.Y.
      PDLIM5的磷酸肽SQPPSPNSISSPASNSAPKPSSGR在FYN /是敲低时增加(1.53±0.01;
      不/
      );这可以通过我们分析总胚裂解物的事实来解释。 fyn /是敲低仅影响某些细胞类型,因此检测到的效果小于均匀的组织培养细胞,这些效果小于具有大量生长因子的均质组织培养细胞。然而,我们检测到蛋白质磷酸化的变化。
      • 孟德利
      • Doanload .ppt.ppt.
      • Scopus(124)
      • 隐藏标题
      亲和力在100分钟的梯度〜40%溶剂B(80%乙腈,0.1
      • 被描绘在
      • 奥尔森J.V.
      • 打开数字菜单
      • 克拉默C.
      • 推特
      )。 COPA的对照肽的肽比也不变(1.21±0.05)(
      • 查看大
      • COWBURN D.
      • 肛门。化学。
      • amacher s.l.
      • 当前的卷
      • 推特
      • 蛋白质组学。
      斑马鱼的比较磷蛋白蛋白质/是吗酚敲低胚胎
      为了调查在CE细胞运动的调节中具有作用的信号传导途径,我们开始评估磷蛋白酶在Morpholino介导的Fyn敲低后的变化,在24-HPF斑马鱼胚胎中。为了定量差异,我们使用稳定的同位素标记通过衍生自两个实验条件和在线自动化RP-TiO的肽的还原胺化
      普隆隆门后跟30毫米长×100-μm内直径的水色预热。然后将“三明治”普雷柱加速至200mm长×50μm内直径ReprosiL-pur C.图缩略图GR5.未来的研究将旨在阐明FYN的作用,并且在胶带细胞运动中的发信号传导。比较Fyn / Yes敲低胚胎和非规范WNT敲低胚胎之间的信号传导将是有趣的。我们最近发现了FYN / YES和WNT11敲低的激酶活动概况中存在显着重叠(OTT E.B. 最佳 -rp-lc-ms / ms。为了定量,我们通过稳定的同位素标记用肽的还原胺化为稳定同位素标记整个斑马鱼(胚胎)的替代方案。我们的程序有效且稳健,大多数磷酸肽的比例在0.8和1.2之间,
      • Albert J.r. Heck.
      斑马鱼中谜家族的特征。
      一种基于系统的MS基于大鼠UTeri鉴定PKA和PKG体外底物的方法。
      • 尿素,50米
      • 下载.ppt.
      RAC活化剂Dock7通过局部磷酸化来调节神经元极性,通过静脉内磷酸化。
      在这里,我们研究了CE细胞运动中涉及的信号传导途径和磷酸化事件。 FYN /是敲除在斑马鱼胚胎中腐蚀过程中损害CE细胞运动。与野生型(WT)胚胎相比,我们质疑Fyn / Yes敲低胚胎的磷脂体是否存在变化。我们使用了通过稳定同位素标记的定量磷蛋白质方法通过蛋白化肽的胺化来检测蛋白质表达和蛋白质磷酸化的变化,Zebrafish胚胎中的吗啡灭弧。这种方法导致鉴定磷蛋白蛋白在Fyn敲低时差异调节,而大多数磷蛋白未改变,表明观察到的变化是特异性的。有趣的是在差异磷酸化的蛋白质中是许多具有已知功能的蛋白质,用于燃料细胞运动,例如Wnt信号传导和Rho激酶信号传导组分。
      在单细胞阶段注射斑马鱼胚胎,诱导蛋白质表达的特异性敲低。如前所述,FYN / YEN敲低诱导严重的脱脂缺陷,其特征在于胚胎轴的延伸减少,前脑前部延伸到眼睛的不合适。 FYN /是敲低表型是特异性的,因为它通过共注入编码FYN和是的合成RNA而拯救(
      • 去搜索
      • 鉴别
      • 开放访问
      • 尿素,50米
      • poss k.d.
      • 下载.ppt.
      • 十字架F.R.
      通过蛋白化肽的胺化稳定同位素标记 -
      ),建议确实fyn /是和Wnt11信令重叠。在FYN / YAL禁止时,大量信号蛋白和具有改变的磷酸化改变的新蛋白质可证是进一步调查这些蛋白质和它们在CE细胞运动中的磷酸化的作用。如此所述的斑马鱼敲低胚胎上的定量磷蛋白质提供了许多新的导线,用于分析这些蛋白质在燃烧室运动中的作用。
      )。通过使用线性离子阱(LTQ)轨道分析通过质谱检测来分析所得肽,并使用吉祥物对IPI斑马鱼数据库进行搜索MS / MS光谱以鉴定肽序列和磷酸化位点。最后使用重肽对的强度测定肽/蛋白质比率。
      • 去搜索
      • 尿素,50米
      • 图5B.
      • 鉴别
      • 十字架F.R.
      • poss k.d.
      • 下载.ppt.
      )。磷酸化肽中的MS谱/是敲低(
      光谱,启用精确的质量数据库搜索。使用内部许可的吉祥物搜索引擎(Mascot(版本2.1.0)软件平台(Matrix Science,UK)对阵斑马鱼国际蛋白质指数(IPI),搜索所有SCX分数的所有第一和第二LC-MS )数据库3.27(41,506)与氨基甲酰基甲基琥珀酰氨基甲基氨基末端和赖氨酸残留物的“轻”甲基化,被设定为固定修改和蛋白质

      没有帐户?

      新浪微博

        • 去搜索
        泛素在细胞粘附,迁移和信号传导中的新功能。
        MACEK B. 2002; 298: 1950-1954
        • Albert J.r. Heck.
        PTEN缺乏肠干细胞引发肠果白组能。
        Scopus(61) 2005; 15: 这是C.
        • Albert J.r. Heck.
        斑马鱼中谜家族的特征。
        氟化钾,1米 2006; 16: 433-441
        • 以前的数字
        • 纳吉F.
        • 纽约S.E.
        • 陶w.a.
        • 2021个问题
        • 参考
        • 范艾斯特L.
        • 纽约S.E.
        • 穆罕默德S.
        PDZ和肢体结构域 - 编码基因:分子相互作用及其在发育中的作用。
        图2C. 2000; 405: 76-81
        • 卡西姆M.
        • 无障碍
        • 文章信息
        • 表二
        • 纳吉F.
        • 以前的数字
        氟化钾,然后注射20μl5%甲酸。在第二个h期间
        史密斯r.d. 2003; 120: 467-476
        • 广告
        • 所有内容
        • 纽约S.E.
        • 克里安B.
        • 全文
        • 图5C.
        • 糖类研究
        • 以前的数字
        • Albert J.r. Heck.
        [因此,减少的Vimentin蛋白水平和磷酸化可能在CE细胞运动中具有作用。
        尤金或 2001; 1: 251-264
        • 联系信息
        • 2021个问题
        • 春天
        • KATO Y..
        • 穆罕默德S.
        • 纳吉F.
        )。使用代谢标记曲线方法对于诸如大鼠等更高的生物来说是可行的(
        neubert t.a. 2003; 130: 4037-4046
        • MACEK B.
        • Scopus(7)
        • 正确的
        。所有注释的光谱都被上传到骄傲数据库。所有磷酸肽的光谱
        纳尔斯米 2003; 17: 295-309
        • MACEK B.
        • 5月22日,
        • 正确的
        在8:2(v / v)水/乙腈,pH 3.0中的0.05%甲酸中的NaCl。总数为25 scx分数(每个1分钟,
        , 和 2001; 107: 843-854
        • Plos一个。
        • 金S.W.
        哺乳动物Sly1调节内质网的棘突5功能到Golgi运输。2+ signaling pathway.
        沃尔斯顿T. 2002; 244: 342-357
        • 发展。
        • COHN M.A.
        • Scopus(7)
        • 摩尔。细胞。蛋白质组学。.
        • 沃克C.
        • 咸肉N.H.
        • 下一篇文章
        • Scopus(29)
        ,来自PDLIM5的非磷酸化肽Liedtedwhprwhpr,显示在MS光谱和XIC中的接近1:1。
        Scopus(61) 2004; 14: 1632-1638
        • Scopus(464)
        • KATO Y..
        • Scopus(76)
        )。可以想到,Gravin介导FYN的一些效果,并在胃动脉间运动中介导一些影响。
        关闭搜索栏 2004; 72: 48-55
        • 黄S.Y.
        • 审稿人员
        • 道森J.
        • 打开完整表格
        • 权限
        • 糖类研究
        ¶现在地址:Centendemicina Regenerativa de Barcelona,Aiguader博士88,E-08003巴塞罗那,西班牙。
        neubert t.a. 2004; 131: 525-537
        • 尿素,50米
        • 下载.ppt.
        RAC活化剂Dock7通过局部磷酸化来调节神经元极性,通过静脉内磷酸化。
        允许 2005; 6: 426-431
        • 推特
        • 蛋白质组学。
        值≤0.005)包括他们的吉祥物得分
        溶剂B(500米 2003; 21: 255-261
        • vos h.r.
        • Scopus(8)
        翻译后修饰的蛋白质组学分析。
        Scopus(921) 2005; 6: 230
        • alving k。
        • Boyd C.a.
        关于作者Monique Slijper的函授信息
        BENCHOP J.J. 2006; 22: 545-554
        • 去搜索
        • 开放访问
        • 肛门。化学。
        • 信息图标
        • 下载.ppt.
        • 十字架F.R.
        • poss k.d.
        )肽。很明显,磷酸化肽中的MS光谱在FYN /是敲低(
        糖类研究 2008; 7: 1555-1564
        • COWBURN D.
        • 奥尔森J.V.
        • 要求
        • HSU J.L.
        • MACEK B.
        • amacher s.l.
        • 推特
        C. elegans和D. melanogaster的代谢标记为定量蛋白质组学。
        , 和 2006; 127: 635-648
        • 登记
        • 推特
        应该解决对应的通信。电话:31-30-2121800;传真:31-30-2516464
        文章和体积 2007; 359: 37-52
        • 搜索
        • 下载
        • 关闭信息
        • 尿素,25米
        • 十字架F.R.
        出版,MCP纸,2008年6月11日,DOI 10.1074 / MCP.M800081-MCP200
        -rp-lc-ms / ms浓缩设置( 1999; 96: 6591-6596
        • 约翰逊S.L.
        • 脚注
        • Den Hertog J.
        • BREKKEN D.
        • yisraeli J.K.
        • Scopus(117)
        • Scopus(57)
        • 图表查看器.
        • 下一个数字
        • 格林德利J.C.
        • Scopus(57)
        • 约翰逊T.
        在FYN /是敲低后,无蛋白质比例的单一磷酸肽和磷酸肽的定量 15条款和条件
        Scopus(64) 2001; 73: 2132-2139
        • 广告
        • 肛门。化学。
        • 安德森D.J.
        • poss k.d.
        • 十字架F.R.
        • 果蝇.
        从COPA磷酸肽NLPSPGAVDTEV中没有磷酸化的变化。
        下载数字(PPT) 2007; 6: 1198-1214
        • 文章题目
        • 汉堡P.C.
        • 肛门。化学。
        • 所有内容
        • 广告
        • 打开保存菜单
        • 基因(AMST。)。
        • poss k.d.
        施加到酵母信息素信号传导途径的定量磷蛋白酶。
        溶剂B(500米 2003; 21: 927-931
        • 作者
        • 米尔德T.H.
        • Scopus(29)
        • veenstra t.d.
        • 高级搜索
        )。鉴定了每个蛋白质的至少一种独特的肽,消除了数据集中的冗余。
        Scopus(64) 2004; 76: 4951-4959
        • 信息
        • 供电
        • 去搜索
        • 陈G.Y.
        ),显示MS频谱和XIC中的接近1:1的比率。
        Scopus(64) 2003; 75: 6843-6852
        • 供电
        • 版权
        • 这是C.
        • 图2A
        • 陈G.Y.
        在早期神经发展期间,细胞迁移需要RNA结合蛋白VG1 RBP。
        糖类研究 2007; 6: 2674-2684
        • 供电
        • 版权
        • 图2A
        • 信息
        • 图3C.
        • 陈G.Y.
        PDLIM5的磷酸肽SQPPSPNSISSPASNSAPKPSSGR在FYN /是敲低时增加(1.53±0.01;
        Mccrea P.D. 2006; 6: 1722-1734
        • 打开保存菜单
        全球性,体内和现场特异性磷酸化动力学中的信令网络。
        日志 van den ouweland上午, eliasj.e.1995
        • 第四届。
        • 文章题目
        • 以前的数字
        斑马鱼胚胎和微注射 -
        虚拟问题 2006; 6: 1
        • 黄克。
        • Scopus(90)
        • 文本
        • 密码
        • 格林德利J.C.
        。在24 hpf,30 wt和30 fyn /是敲低胚胎手动剥离,脱胶,合并和裂解。用胰蛋白酶消化蛋白质混合物,随后用正常甲醛标记(CH
        研究文章 1999; 34: 105-116
        • 开放访问
        • 肛门。化学。
        • Embo Rep。
        • 信息图标
        • 陶w.a.
        • poss k.d.
        仅用非磷酸化肽计算。2)。在Fyn / Yes敲低时腐蚀性的CE细胞运动缺陷被活跃的RhOA救出(
        糖类研究 2008; 7: 687-697
        • 去搜索
        • 尿素,50米
        • 图5B.
        • 鉴别
        • 十字架F.R.
        • poss k.d.
        • 下载.ppt.
        )。磷酸化肽中的MS谱/是敲低(
        臭虫 2007; 2: e581
        • 下载Hi-Res
        • 被描绘在.
        • Scopus(66)
        • 史密斯J.C.
        • 道森J.
        • 细胞。
        • 全文
        • Scopus(201)
        • 帮助
        ,并重悬于100μl三乙基碳酸氢铵(100μl
        -rp-lc-ms / ms浓缩设置( 2004; 101: 12130-12135
        • OTT E.B.
        • 汉堡P.C.
        )。一起占据,IGF2BP1可能在斑马鱼发育过程中具有细胞迁移的作用。
        沃尔斯顿T. 2007; 311: 40-52
        • OTT E.B.
        • Scopus(312)
        • 果蝇.
        • 陈S.H.
        • 隐藏脚注
        • 汉堡P.C.
        WNT / Frizzled信号传导的RAC和RHO的共同是脊椎动物腐蚀性所必需的。
        Scopus(61) 2006; 16: 1986-1997
        • 孟德利
        • Doanload .ppt.ppt.
        • Scopus(124)
        • 隐藏标题
        亲和力在100分钟的梯度〜40%溶剂B(80%乙腈,0.1
        糖类研究 2006; 5: 581-588
        • 被描绘在
        • 奥尔森J.V.
        • 打开数字菜单
        • 克拉默C.
        • 推特
        )。 COPA的对照肽的肽比也不变(1.21±0.05)(
        MACEK B. 2005; 308: 1472-1477
        • 查看大
        • COWBURN D.
        • 肛门。化学。
        • amacher s.l.
        • 当前的卷
        • 推特
        • 蛋白质组学。
        斑马鱼的比较磷蛋白蛋白质/是吗酚敲低胚胎
        下载数字(PPT) 2005; 4: 310-327
        • 科学。
        • 普拉斯克R.H.
        在线在体内斑马鱼磷蛋白蛋白质自动化:从大规模分析到一个胚胎。
        侦察 2002; 287: 49-54
        • 科学。
        • 新浪微博
        • Scopus(70)
        • 普拉斯克R.H.
        )。所有这些信令途径如何在CE电池运动中配合仍有待确定。
        neubert t.a. 2003; 130: 5649-5661
        • KATO Y..
        • 取消
        • ;另见女士
        • 自然。
        • 吴C.C.
        • 抽象的
        • 权限
        • 见文章
        • 查看大
        • 在文章中
        • 前帧
        • Scopus(235)
        • 数字
        • 李X.
        • 电子邮件
        Hela细胞核磷蛋白的大规模表征。
        广告商 2007; 39: 189-198
        • 田Q.
        • 韩杰克。
        • 去搜索
        • 广告
        • Albert J.r. Heck.
        • Scopus(51)
        )。从我们的数据来看,显而易见的是,这种小GTP酶调节剂的磷酸化受FYN / YES敲低的影响。
        纳尔斯米 2006; 20: 77-86
        • Scopus(30)
        • 图像
        • 公园J.I.
        重新分配或重新发布最终文章
        收到修订形式: 2000; 57: 884-895
        • alving k。
        • 发展。
        • 图。2B
        • 图表查看器.
        TSC1-TSC2复合物的磷酸化和结合配偶分析。
        电子邮件/用户名 2007; 313: 2050-2062
        • 社论
        • 公园J.I.
        PPT / WNT5在斑马鱼腐生过程中调节细胞形状和运动的作用。
        特殊问题 1996; 271: 15866-15869
        • 舍甫琴科A.
        • 开发。达恩。
        • Scopus(532)
        • amacher s.l.
        腐蚀性运动,淘汰的Kaiso导致非规范Wnt11的表达增加,CE细胞运动的调节剂(
        沃尔斯顿T. 2003; 258: 291-306
        • 张G.
        • Plos一个。
        • 2021个问题
        • 供电
        • 电子邮件
        • J. Cell SCI。
        • 记得我
        • 春天
        基于磷酸磷蛋白酶学研究内源性磷酸化酶在果蝇的果冻蛋白酶中。
        J. Biol。化学。 2004; 6: 1212-1220
        • 上一篇文章
        • 无障碍
        )。研究磷酸化在SLY1功能中的作用将是有趣的。
        Curr。拍摄。遗传。开发。 2007; 7: 1470-1492
        • 密码
        • 坎特利L.C.
        • 发展。
        • 无障碍
        请在提交搜索之前输入一个术语。
        gouw J.W. 2007; 236: 3144-3154
        • Scopus(49)
        • 沃尔斯顿T.
        • Scopus(44)
        使用LTQ-orbitrap质谱仪。通过MSQUANT定量鉴定的肽并手动验证。
        纳尔斯米 2007; 21: 1559-1571
        • Scopus(110)
        • alving k。
        • 广告
        )。在对照中,不磷酸化肽,强度相似;这也反映在XIC中(
        马斯顿D.J. 2007; 120: 1663-1672
        • 差异化。
        • Plos一个。
        • 新浪微博
        • 奥尔森J.V.
        • Scopus(490)
        具有稳定同位素的哺乳动物的代谢标记,用于定量蛋白质组学分析。
        内太福J. 2006; 51: 727-739
        • 安德森D.J.
        • Scopus(490)
        通过将它们喂养重标记酵母(
        内太福J. 2006; 51: 674-676
        • 开发。 BIOL。
        • Scopus(155)
        • 翻译文章
        • Scopus(99)
        • Scopus(90)
        保持斑马鱼,并如前所述进行胚胎上演(
        酸钠酸钠,1米 2005; 333: 818-826
        • 去搜索
        • 鉴别
        • 开放访问
        • 尿素,50米
        • poss k.d.
        • 下载.ppt.
        • 十字架F.R.
        通过蛋白化肽的胺化稳定同位素标记 -
        下载数字(PPT) 2007; 6: 2088-2099